单细胞转录组鉴定阿尔茨海默病外周血生物标志物GZMK~+CD8~+T细胞

段婷婷; 初金语; 胡斐斐

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目的基于单细胞RNA测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)挖掘阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)外周血免疫特征作为生物标志物,系统性探索AD外周血免疫细胞亚型丰度、基因表达特征和细胞通讯异常。方法从GEO数据库中下载AD外周血免疫细胞scRNA-seq数据集GSE168522,于RAD-Blood网页服务器(http://www.bioinform.cn/RAD-Blood/)中分析AD患者血液细胞组成成分变化,利用CellChat分析AD患者血液中异常的细胞间通讯作用。结果AD患者和健康人血液中有两种CD8^(+)T细胞,其中一类高表达颗粒酶K(granzyme K,GZMK)[伪发现率(false discovery rate,FDR)<0.05],另一类高表达GZMA、GZMB和GZMH(FDR<0.05)。GZMK^(+)CD8^(+)T细胞在AD患者血液中含量升高32.9%(P=5.15E-21),与其他细胞类型的交互作用增加,并可能通过主要组织相容性复合体Ⅰ类(major histocompatibility complex classⅠ,MHC-Ⅰ)信号转导异常与AD关联,红细胞为GZMK^(+)CD8^(+)T细胞MHC-Ⅰ信号通路异常提供了主要配体,即人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)Ⅰ类分子(HLA-A、HLA-B、HLA-C和HLA-E)。血液RESISTIN信号通路仅富集于AD患者血液中,其可能是AD血液特异性信号通路。结论外周血GZMK^(+)CD8^(+)T细胞含量升高、GZMK^(+)CD8^(+)T细胞与红细胞的交互作用增加、RESISTIN通路增强是潜在的AD标志物。

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来源
《四川大学学报：医学版》 |2023年第5期|863-873|共11页
作者
段婷婷; 初金语; 胡斐斐;
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作者单位

武汉科技大学医学院脑科学先进技术研究院;

武汉430081;

武汉科技大学附属亚洲心脏病医院;

武汉430022;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 R749.16;
关键词
阿尔茨海默病; 单细胞RNA测序; 血液生物标志物; CD8^(+)T细胞;

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