反向点杂交法检测广东地区丙型肝炎病毒基因型和基因亚型

魏君锋; 侯金林; 郭亚兵; 周元平; 张太松; 黄辉红; 曾艳丽; 张帆; 王俊洁; 周斌; 吴英松; 刘叔文

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目的建立并应用HCV基因分型技术PCR-反向点杂交法(PCR-RDH),调查广东地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型和亚型的分布情况.方法应用生物信息学软件针对HCV 5'端非编码区(5'UTR)和核心蛋白区(C区)设计特异性捕获探针及生物素标记引物,建立HCV基因分型的PCR-反向点杂交技术.应用本技术对115例慢性丙型肝炎患者血清标本进行HCV基因型和亚型检测,同时对其中38份标本中的HCV进行RT-PCR扩增、测序、系统进化树分析确定HCV基因型和亚型,以评价反向点杂交法的准确性及临床应用价值.结果 115份血清标本中,反向点杂交法HCV基因型及亚型检出率为96.5%(111/115),15份阴性对照全部为阴性.111例检出基因型的标本中1b型63例(56.8%)、2a型9例(8.1%)、3a型4例(3.6%)、3b型6例(5.4%)、6a型28例(25.2%)、1b/2a混合型1例(0.9%).经测序分型确定此法检测准确度为100%,特异度为100%.结论 HCV基因型反向点杂交法检测准确可靠、简便经济、高效,适用于临床检测.广东地区的HCV基因型分布以1b型为主,呈现出1b型比例下降,3a、6a型比例升高的趋势.

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来源
《南方医科大学学报》 |2010年第10期|2270-22722276|共4页
作者
魏君锋; 侯金林; 郭亚兵; 周元平; 张太松; 黄辉红; 曾艳丽; 张帆; 王俊洁; 周斌; 吴英松; 刘叔文;
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作者单位

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

中山大学达安基因诊断中心,广东,广州,510665;

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

中山大学达安基因诊断中心,广东,广州,510665;

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

南方医科大学南方医院感染内科,广东,广州,510515;

南方医科大学生物技术学院,广东,广州,510515;

南方医科大学药学院,广东,广州,510515;

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正文语种 chi
中图分类 R512.63;
关键词
反向点杂交; 丙型肝炎病毒; 基因型; 基因亚型;

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