湖南益阳黑茶中桔青霉线粒体全基因组序列测定及分析

胡治远; 刘素纯; 徐正刚; 刘石泉; 文欣

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湖南益阳黑茶中桔青霉线粒体全基因组序列测定及分析

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对黑茶中分离的一株桔青霉线粒体基因序列进行测定与分析,并探究其与近缘种微生物的系统发育关系.结果表明,桔青霉线粒体基因组是一条全长27537 bp的环状DNA分子,共编码42个基因(15个蛋白质编码基因,2个rRNA,24个tRNA以及1个独立的ORF),基因组碱基构成为:A(36.17％)、T(37.06％)、C(11.82％)、G(14.95％).15个蛋白质编码基因均采用典型的ATG作为起始密码子、TAA或TAG作为终止密码子,基因排列顺序与已报道的青霉属物种相似,在进化上较为保守.蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为Leu、Ile、Ser和Phe;RSCU频率最高的4个密码子依次是UUA、AUA、UUU和GGU.24个tRNA基因存在30处G-U错配,均可形成典型三叶草结构.系统发育分析结果表明,桔青霉分类地位上关系最密切是Penicillium ShG4C,其次是Penicillium polonicum与Penicillium nordicum.

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来源
《茶叶科学》 |2020年第6期|830-844|共15页
作者
胡治远; 刘素纯; 徐正刚; 刘石泉; 文欣;
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作者单位

湖南农业大学食品科学技术学院湖南长沙 410128;

湖南城市学院材料与化学工程学院湖南益阳 413000;

湖南农业大学食品科学技术学院湖南长沙 410128;

湖南城市学院材料与化学工程学院湖南益阳 413000;

湖南城市学院材料与化学工程学院湖南益阳 413000;

湖南省食品质量监督检验研究院湖南长沙 410111;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类茶;
关键词
黑茶; 桔青霉; 线粒体基因组; 系统发育;

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