基于TCGA数据库分析JMJD6在肝癌组织中的表达及临床意义

赵冉; 武燕洁; 刘振凤; 冯圣鋆; 兰蓓

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基于TCGA数据库分析JMJD6在肝癌组织中的表达及临床意义

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目的:分析JMJD6在肝癌中的表达及与预后的关系。方法:从TCGA数据库中下载肝癌患者的mRNA表达数据及患者临床信息。利用Wilcoxon检验比较肝癌组织和正常组织中JMJD6的表达差异,单因素Logistic回归分析JMJD6表达量与临床特征的关系。通过Kaplan-Meier法和Cox回归分析JMJD6表达量与患者生存率的关系。将肝癌组织分成JMJD6高表达组和低表达组并进行基因集富集分析(GSEA)。结果:与正常组织相比,JMJD6在肝癌组织中高表达(W=2506,P<0.001),且表达量与临床分期和病理分级相关(均P<0.05)。JMJD6高表达导致患者生存率下降(χ^(2)=5.541,P<0.05),并且是肝癌患者预后的独立危险因素(HR=1.109,95%CI:1.039~1.184,P<0.01)。此外,GSEA结果显示JMJD6高表达组在DNA复制、RNA剪接等通路富集,低表达组在脂肪酸和氨基酸代谢通路富集。结论:JMJD6高表达与肝癌的发生、发展及患者不良预后相关。

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来源
《天津医科大学学报》 |2022年第1期|15-19|共5页
作者
赵冉; 武燕洁; 刘振凤; 冯圣鋆; 兰蓓;
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作者单位

天津医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系;

天津300070;

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正文语种 chi
中图分类肝肿瘤;
关键词
TCGA; 肝癌; JMJD6; 预后分析;

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