基于大量ChIP数据集的果蝇顺式调控模块的从头预测

李婷; 张少强

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通过整合果蝇已有的ChIP数据集,采用模体发现算法FisherNet及高性能并行的模体聚类算法CLIMP对果蝇的顺式调控模块进行从头预测.与已知的顺式调控模块进行比对分析,结果表明该方法预测结果覆盖了数据集中已知顺式调控模块的82.93％,证明该方法具有一定的普适性.与较新的DePCRM算法进行比较,结果表明本算法在从头预测顺式调控模块上速度更快、精度更高.

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来源
《天津师范大学学报（自然科学版）》 |2018年第2期|73-76|共4页
作者
李婷; 张少强;
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作者单位

天津师范大学计算机与信息工程学院,天津300387;

天津师范大学计算机与信息工程学院,天津300387;

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正文语种 chi
中图分类基因工程（遗传工程）;
关键词
ChIP数据集; 果蝇; 顺式调控模块; 模体; FisherNet; CLIMP;

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