原核生物大肠杆菌基因组序列形成核小体能力的预测

陈冰; 任松叶; 赵秀娟; 蔡禄

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以大肠杆菌基因组为研究对象,基于体外组装的核小体序列中k-mers频数信息,采用多样性增量结合二次判别算法对核心DNA和连接DNA进行分类预测,整体准确率和相关系数分别达到83.08%和0.619.对大肠杆菌、酵母和人类基因组中核小体定位序列与缺失序列中偏好的k-mers进行了比较,结果表明核小体缺失序列更为保守.

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来源
《信阳师范学院学报：自然科学版》 |2013年第2期|204-207|共5页
作者
陈冰; 任松叶; 赵秀娟; 蔡禄;
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作者单位

内蒙古科技大学生物工程与技术研究所;

内蒙古科技大学生物质能源化重点实验室;

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正文语种 chi
中图分类遗传学分支学科;
关键词
大肠杆菌基因组; 核小体定位; k-mers频数; 多样性增量; 二次判别;

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