HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究

王宁; 邓圣荣; 金毅; 徐四川; 何耀莹

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HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究

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1RT1蛋白是一个HIV-1逆转录酶核心蛋白,是抑制剂药物分子的作用靶点.非核苷类抑制剂MKC分子是1RT1蛋白中的配体分子.采用量子力学密度泛函理论,B3LYP计算方法,结合6-31G(d,p)基组,逐个计算MKC分子与其周围半径0.7 nm结构范围内的34个氨基酸残基相互作用和结合能,发现在1RT1蛋白中103Lys残基是MKC分子的结合作用位点,结合能值为-46.73 kJ.mol-1.该结合位点的发现将为进一步设计和寻找抗HIV-1逆转录酶抑制剂药物分子提供一些理论基础.

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来源
《云南民族大学学报：自然科学版》 |2009年第1期|37-40|共4页
作者
王宁; 邓圣荣; 金毅; 徐四川; 何耀莹;
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作者单位

云南大学化学科学与工程学院;

教育部自然资源药物化学重点实验室;

浙江工商大学食品与生物工程学院;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类氨基酸、肽、蛋白质;
关键词
HIV-1; 1RT1蛋白; MKC; 结合位点; DFT;

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