火龙果MADS-box基因家族鉴定及表达分析

魏开发; 张薇

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火龙果MADS-box基因家族鉴定及表达分析

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目的为了探索火龙果中MADS-box转录因子在成花诱导及花器官形成中的作用机制.方法针对9月份取材的"大红二号"8个不同的组织进行火龙果从头测序,并对MADS-box转录因子全基因家族进行生物信息学的分析.结果在火龙果转录组中一共鉴定出48个具完整结构域HuMADS蛋白,氨基酸长度65～411 aa.依据系统发育分析和结构域的差异,HuMADS基因分布在4个亚家族:Mα(6),Mγ(5),MIKCC(33)和MIKC*(2)以及none组(2),未发现Mβ成员.表达谱分析显示相对于Lineage I而言Lineage II表达水平整体较高,其中Group 1基因主要在花和果实中表达;Group 2基因在枝条、花和果实中均有表达;Group 3基因在Fl510、Fl513和枝条中组织特异性表达.同源分析得到与花器官形成相关的5类功能基因,A类基因AP1(HuMADS18),B类AP3(HuMADS33)和PI(HuMADS38)、C类AG(HuMADS12)、以及D类STK(HuMADS11)和E类SEP1(HuMADS16)、SEP3(HuMADS15和HuMADS17).结论本研究为进一步探索火龙果花发育提供了理论基础.

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来源
《漳州师范学院学报（自然科学版）》 |2018年第4期|53-60|共8页
作者
魏开发; 张薇;
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作者单位

闽南师范大学生物科学与技术学院,福建漳州363000;

闽南师范大学生物科学与技术学院,福建漳州363000;

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正文语种 chi
中图分类其他;
关键词
火龙果; 转录组测序; MADS-box; 基因家族; 表达分析; 花发育;

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