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宏基因组二代测序在粒细胞缺乏伴发热患者病原菌检测中的价值

         
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目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在化疗后粒细胞缺乏伴发热患者病原菌检测中的价值。方法 回顾性分析2019年6月—2020年9月西安市中心医院19例化疗后粒细胞缺乏伴发热患者的临床资料。比较mNGS与传统微生物培养、免疫学相关检测[G试验、GM试验、革兰阴性菌脂多糖(GNBL)]的阳性率和所需时间。采用受试者工作特征(ROC)曲线分析3种方法检测病原的效能。结果 19例患者临床送检样本包括血液样本(8例)、咽拭子样本(7例)、脑脊液样本(1例)、胸腔积液和腹腔积液样本(2例)、尿液样本(1例)。19例样本mNGS、微生物培养、免疫学相关检测阳性率分别为68.4%、26.3%、63.2%。13例mNGS阳性样本中,10例检出革兰阴性菌、4例检出革兰阳性菌、4例检出真菌、3例检出病毒、1例检出支原体;mNGS、微生物培养、免疫学相关检测检出病原所需时间分别为(47.0±13.2)、(84.0±31.6)、(24.8±16.4)h,mNGS较微生物培养所需时间更短(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,mNGS、微生物培养、免疫学相关检测检出病原的曲线下面积分别为0.806、0.688、0.550,敏感性和特异性分别为72.10%和68.46%、30.70%和82.94%、70.9%和30.70%;3种方法比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 mNGS可以提高病原检测效率和可靠性,较传统微生物培养和免疫学相关检测,在粒细胞缺乏伴发热患者病原检测中有一定的优势。

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