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不同民族前列腺癌患者癌组织miRNA表达差异研究

         

摘要

目的通过高通量测序探索不同民族前列腺癌患者生物学差异的候选miRNA,寻找潜在的肿瘤标志物。方法选取2020年10月-2021年8月新疆医科大学第一附属医院收治的病理确诊为汉族(HANC组)、维吾尔族(WEIC组)前列腺癌患者各18例,哈萨克族(HAC组)前列腺癌患者3例,前列腺增生(HANN组)患者18例。使用穿刺组织提取RNA进行测序,筛选差异表达的miRNA并进行靶基因预测及功能分析。采用qRT-PCR技术检测5个候选miRNA表达水平并进行扩大样本量验证。结果通过高通量测序,HANC、WEIC、HAC、HANN各组分别获得18490709条、14440655条、17192254条、17069016条原始测序序列,经过对测序片段碱基的质量检验和长度筛选,各组获得干净序列分别为15814065条、13418490条、16318109条、16399958条。筛选的差异表达miRNA中WEIC组较HAC组上调4个miRNA,下调8个miRNA;WEIC组较HANC组上调15个miRNA,下调21个miRNA;HAC组较HANC组上调20个miRNA,下调16个miRNA;HANC组较HANN组上调69个miRNA,下调76个miRNA。功能预测显示,不同民族间差异miRNA的靶基因参与的KEGG通路具有一定的相似性;qRT-PCR验证了5个候选miRNA,结果显示HANC组和WEIC组中hsa-miR-4485-3p和hsa-miR-619-5p表达水平高于HANN组,hsa-miR-339-3p表达水平则低于HANN组(P0.05)。此外,qRT-PCR验证结果与高通量结果表达趋势一致。结论hsa-miR-619-5p和hsa-miR-339-3p有潜力作为前列腺癌与前列腺增生患者分子诊断标志物。

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