基于生物信息学分析扩张型心肌病发病机制中潜在的自噬关键基因

倪胜南; 陈一鸣

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基于生物信息学分析扩张型心肌病发病机制中潜在的自噬关键基因

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目的通过生物信息学分析扩张型心肌病中潜在的自噬相关基因,为临床治疗提供参考。方法基于GEO数据库中GSE3586数据集筛选扩张型心肌病的mRNA表达谱。通过R软件筛选得到扩张型心肌病自噬相关潜在基因。随后利用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)、相关分析、基因本体论(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析扩张性心肌病自噬相关差异基因。结果在13个扩张型心肌病患者和15个正常人群的室间隔组织样本中鉴定出21个基因与自噬密切相关,其中15个上调基因和6个下调基因。PPI分析显示,扩张型心肌病与自噬相关差异基因之间存在相互作用;GO和KEGG富集分析显示,扩张型心肌病与自噬相关差异基因与细胞自噬的生物学功能和自噬信号通路密切相关。结论自噬相关基因通过调节自噬、凋亡和内分泌抵抗等通路在扩张型心肌病的发病机制中起着重要的作用,为扩张型心肌病后续的治疗和研究提供指导作用。

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来源
《医学信息》 |2023年第1期|17-23|共7页
作者
倪胜南; 陈一鸣;
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作者单位

江苏省泗阳康达医院检验科;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类心肌疾病;
关键词
扩张型心肌病; 自噬; 生物信息学;

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