三种miRNA对肝癌预后预测的生物信息学分析模型

林思其; 张泽鑫; 夏睿琪; 刘紫凤; 陈林静; 陈栩静; 陈祎琦

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三种miRNA对肝癌预后预测的生物信息学分析模型

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目的通过TCGA数据库构建一种miRNA预后模型,预测肝癌的预后。方法通过edgeR软件包对miRNA和mRNA的表达数据进行分析和标准化,并与生存率相结合分为两组。通过单因素和多因素Cox回归分析构建3种与总生存率明显差异相关的miRNA,使用ROC曲线评价其可靠性。通过miRDB、TargetScan和miRTarBase 3个数据库筛选出miRNA的靶基因,并运用GO和KEGG探究其相关作用机制。使用Cytoscape3.7.2和String数据库筛选出前10个中枢基因。结果共筛选出47个靶基因与生存预后显著相关;ROC曲线结果显示,三组的AUC分别为0.789、0.730、0.763,说明模型预测HCC患者预后的能力;回归分析显示,该模型可独立影响肿瘤的预后情况,包括T分期、临床分期及远处转移的存在。结论hsa-miR-3682-3p、hsa-miR-9-5p和hsa-miR-139-5p三种miRNA的生物学分析模型可以预测HCC患者的预后,且可以作为HCC中独立的预后因素。

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来源
《医学信息》 |2022年第3期|81-85|共5页
作者
林思其; 张泽鑫; 夏睿琪; 刘紫凤; 陈林静; 陈栩静; 陈祎琦;
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作者单位

广州中医药大学第二临床医学院;

广州中医药大学第一临床医学院;

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正文语种 chi
中图分类肝肿瘤;生物信息、生物控制;
关键词
肝细胞癌; MICRORNA; 预后; TCGA;

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