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临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布及其与毒力基因的关系

         

摘要

[目的]了解临床分离志贺菌中CRISPR/Cas系统的分布特征并分析其与毒力基因的关系.[方法]以聚合酶链式反应(PCR)方法,采用10对引物分别对57株临床分离志贺菌中CRISPR1、cas2-cas1、cas6e-cas5、cas7、cse2、cse1-cas3基因和毒力基因ipaH、ial、ipaBCD、virA进行检测.对CRISPR1的PCR结果进行测序,并用CRISPR finder在线软件对CRISPR1基因座进行分析.通过卡方检验初步分析CRISPR/Cas系统与毒力基因的关系.[结果]测序结果显示,CRISPR1基因座中间隔序列数目较少且在不同菌株间一致性较高;57株志贺菌中,84.2%(48/57)的志贺菌中可检测到CRISPR/Cas系统,其中68.8% (33/48)的志贺菌中cas6e-cas5基因或(和)cse2基因中发现插入序列;毒力基因ipaH、ial、virA、ipaBCD的检出率依次为100%、100%、98.2%和87.7%;毒力基因ipaBCD的阳性率与活性CRISPR/Cas系统的分布无关(P>0.05).[结论]CRISPR/Cas系统广泛存在于临床分离志贺菌中;部分cas基因中有插入序列;并未发现志贺菌中活性CRISPR/Cas系统与毒力基因的分布有关.

著录项

  • 来源
    《微生物学通报》 |2015年第3期|543-549|共7页
  • 作者单位

    郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001;

    河南科技大学 预防医学教研室 河南 洛阳 471023;

    郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001;

    新乡医学院分子诊断与医学检验技术河南省协同创新中心 河南 新乡 453003;

    郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001;

    郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001;

    郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001;

    郑州大学 公共卫生学院流行病与卫生统计学系 河南 郑州 450001;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    志贺菌; CRISPR/Cas系统; 聚合酶链式反应; 插入序列; 毒力基因;

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