基因组挖掘技术在海洋放线菌天然产物研究开发中的应用及展望

陈亮宇; 王玉梅; 赵心清

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基因组挖掘技术在海洋放线菌天然产物研究开发中的应用及展望

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利用微生物的基因组信息预测其合成特定天然产物的潜能,进而进行新化合物分离纯化和结构鉴定的基因组挖掘技术,已经成为国内外研究的热点,并在多种细菌和真菌的天然产物发现中得到成功应用.本文综述了基因组挖掘技术的最新进展,包括生物信息分析和结构预测、基因组指导的天然产物的发现、沉默基因的激活和异源表达技术等,以及我国学者开发的转录组挖掘技术,并重点综述了影像质谱技术在基因组挖掘中的应用.目前对海洋放线菌进行基因组挖掘的研究还比较少,而基因组挖掘技术的发展,将极大地促进对海洋放线菌天然产物的发现和鉴定.未来除了充分挖掘可培养微生物的基因组,对未培养微生物宏基因组的挖掘将进一步深入.此外,除了开发利用基因组中合成天然产物的结构基因和调节基因,还应该充分开发利用其他不同的遗传元件,包括不同转录活性和响应不同环境条件和信号的启动子,以及具有调节作用的RNA等.

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来源
《微生物学通报》 |2013年第10期|1896-1908|共13页
作者
陈亮宇; 王玉梅; 赵心清;
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作者单位

大连理工大学生命科学与技术学院辽宁大连 116023;

大连理工大学生命科学与技术学院辽宁大连 116023;

大连理工大学生命科学与技术学院辽宁大连 116023;

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正文语种 chi
中图分类
关键词
海洋放线菌; 天然产物; 基因簇; 基因组挖掘; 影像质谱;

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