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22株猪瘟病毒E2基因部分编码序列的序列分析

         

摘要

利用RT-PCR方法获得了13株猪瘟病毒分离株、石门系强毒、中国C株及法国温度敏感株Thiverval株的E2基因部分编码序列的扩增片段,并对其进行了测序,得到了251bp的E2基因部分编码序列.利用DNAStar软件对其中224bp的片段进行了序列分析,并与已发表的Alfort、Brescia等毒株进行比较,结果13株猪瘟分离株所测片段均为猪瘟病毒E2基因的序列,与石门系强毒的序列相比所有毒株的碱基替换随机地分布于整个序列,无碱基缺失和碱基插入.其中变化较大的区域位于序列的3'端.22株HCVE2基因部分编码序列的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为:78.1%~100%、78.4%~100%,其中13株猪瘟病毒流行毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为:78.1%~100%、78.4%~100%,4株70~80年代分离的毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为:79.0%~88.3%、81.1%~87.8%,9株90年代分离的毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为:80.8%~100%、83.8%~100%;说明猪瘟病毒流行株的变异呈现一定的多样性

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