利用Hadoop/HBase的药物基因组数据云存储实践研究

范云满; 洪娜; 钱庆; 方安

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利用Hadoop/HBase的药物基因组数据云存储实践研究

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【目的】探索在导入、保存、检索、批量导出生物医学大数据方面的新思路和新方法,积累第一手经验。【方法】分析生物医学大数据的特点,从理论方面和数据查询对比实验两个方面,对比分析以Oracle为代表的传统关系数据库和以HBase为代表的No SQL数据库在解决大数据问题时各自采用的技术以及各自的优势与不足。以一个药物基因组数据存储系统为例,进行云存储实践和初步的对比实验。【结果】HBase在处理大量数据的实际应用中,比Oracle更具优势。【局限】没有对药物基因组学数据进行深入挖掘分析,同时需要对Hadoop/HBase做深入的技术优化。【结论】HBase在本文实验的应用场景中能够满足生物医学大数据存储的要求。

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来源
《现代图书情报技术》 |2015年第5期|73-79|共7页
作者
范云满; 洪娜; 钱庆; 方安;
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作者单位

中国医学科学院医学信息研究所;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 TP311.13;
关键词
生物医学; 大数据; 关系数据库; NoSQL; Hadoop; HBase;

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