龙须菜5．8S rRNA和ITS区的克隆与系统学分析

李敏; 隋正红; 易恒; 张学成; 阎炳伦; 朱明

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研究青岛产龙须菜居群内的遗传多样性和系统学分类,通过对龙须菜居群内不同个体的5.8S rRNA-ITS区(包括ITS1-5.8S rRNA-ITS2)进行PCR扩增和序列分析,得到扩增DNA片段长度均为1 066 bp,包含完整的ITS1(250 bp)、5.8S(159 bp)和ITS2(657 bp);利用GenBank数据库对Gracilaria(江蓠属)和Gracilariopsis属共20个物种的rRNA-ITS相应序列进行了比较和系统进化分析。结果表明,龙须菜和江蓠科19个物种中rRNA的5.8S区的长度和序列非常保守,而ITS区的长度和序列则变异较大,20种江蓠科物种的遗传距离在0.013～0.596之间,龙须菜在5.8S rRNA-ITS区特性上相比江蓠属物种与Gracilariopsis属物种更为相似;采用UPGMA法构建了这20种江蓠科物种的系统发育树;分析结果表明青岛产龙须菜的居群内不存在遗传差异,且应属于Gracilariopsis属,并且在江蓠科中较早分化,而龙须菜处于Gracilariopsis属中比较古老的位置。

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来源
《中国海洋大学学报：自然科学版》 |2009年第1期|77-83|共7页
作者
李敏; 隋正红; 易恒; 张学成; 阎炳伦; 朱明;
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作者单位

中国海洋大学海洋生命学院;

山东青岛266003;

淮海工学院海洋学院;

江苏连云港222005;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类分子遗传学;
关键词
龙须菜; 江蓠科; 5.8S; rRNA-ITS; 系统发育;

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