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首页> 中文期刊> 《植物生理与分子生物学学报》 >病原菌诱导转录的水稻Rim2家族转座酶编码亚组的结构与分布

病原菌诱导转录的水稻Rim2家族转座酶编码亚组的结构与分布

         
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摘要

以基因组克隆Rim2-569为代表, 分析了该家族中转座酶编码亚组的分子结构, 同时对Rim2因子在染色体和不同水稻品种之间的差别分布情况进行了研究.序列分析表明, Rim2-569具有完整的16-bp的末端颠倒重复序列(TIRs)、若干正向和反向的16-bp的亚末端重复 (STRs) 以及插入位点3-bp的同向重复.它的TIRs上具有保守序列CACTG, 有别于以往报告的CACTA转座子.该因子含有一个编码区, 与已报告的Rim2 cDNA的ORF基本一致, 其预测编码蛋白与CACTA转座子编码的转座酶TNP2和TNPD有低度的同源性. 该亚组的其它因子的分子结构均与Rim2-569的相似, 但这些因子预测ORF长度上存在着差异, 反映了结构上的多样性.对检索到的Rim2因子的定位作图表明,它们在已测序拼接完成的第1、4和10号染色体上呈不均匀分布,以着丝点附近的分布频率为最高.PCR反应显示, Rim2编码因子在品种之间存在着编码序列多态性.

著录项

  • 来源
    《植物生理与分子生物学学报》 |2003年第3期|257-264|共8页
  • 作者

    田平芳; 王国栋; 吴刚; 李群; 罗利军; 李德葆; 何祖华;

  • 作者单位

    浙江大学生物技术研究所,杭州,310029;

    中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032;

    中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032;

    华东师范大学生物系,上海,200062;

    中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032;

    中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032;

    上海市农业生物基因中心,上海,201106;

    浙江大学生物技术研究所,杭州,310029;

    浙江大学生物技术研究所,杭州,310029;

    中国科学院上海生命科学研究院上海植物生理生态研究所SHARF和植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 生物小分子的结构和功能;
  • 关键词

    水稻; Rim2因子; 转座酶编码亚组; 分子结构; 分布;

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