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基于MSAP技术的刺参选育群体基因组表观与序列遗传多样性分析

         

摘要

抗逆选育引起的遗传变化不仅源于DNA序列的变化,也有来自于表观层面的修饰改变.为探究刺参(Apostichopus japonicus)耐高温新品系育种过程中的选育基础群体与选育群体的遗传多样性,运用MSAP技术分析了选育基础群体F、选育F1代和选育F4代的基因组遗传多样性.结果显示,10对引物获得的806个位点中,多态性位点为698个,多态性百分比达到86.60%;基于非甲基化位点的遗传分析,选育F4代香农多态性指数为0.3981,Nei基因多样度为0.2264;基于甲基化敏感位点分析,选育F4代香农多态性指数为0.5873,Nei基因多样度为0.2598,均高于基础群体;表观遗传多样性均大于非甲基化位点变异产生的序列遗传多样性,表明表观变异出现频率高于序列遗传变异.MSAP甲基化模式分析显示,选育F1和F4代经过选育后获得了一些甲基化水平和模式的改变,说明经温度胁迫选育,改变了刺参群体的基因组的甲基化状态.选育F4代获得的类型Ⅱ的条带数最多,为161条,明显高于未选育刺参,为选育获得表观遗传特征.研究结果从遗传物质基础角度揭示了选育群体的遗传改变与进展,可为抗逆新品种选育中的表观遗传研究提供参考.

著录项

  • 来源
    《渔业科学进展》 |2021年第3期|38-45|共8页
  • 作者单位

    上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心 上海 201306;

    上海海洋大学 上海水产养殖工程技术研究中心 上海 201306;

    鲁东大学农学院 烟台 264025;

    上海海洋大学 水产科学国家级实验教学示范中心 上海 201306;

    上海海洋大学 上海水产养殖工程技术研究中心 上海 201306;

    鲁东大学农学院 烟台 264025;

    山东省农业农村厅 济南 250013;

    山东省渔业技术推广站 济南 250013;

    鲁东大学农学院 烟台 264025;

    烟台海育海洋科技有限公司 烟台 264001;

    鲁东大学农学院 烟台 264025;

    鲁东大学农学院 烟台 264025;

    鲁东大学农学院 烟台 264025;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 其他海产动物养殖;
  • 关键词

    刺参; MSAP; DNA甲基化; 选育群体; 遗传多样性;

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