DNA甲基化

摘要： 背景:同型半胱氨酸水平增加会导致胰岛β细胞发生凋亡,但其具体机制尚不明确。目的:探讨胰岛β细胞中肝配蛋白A型受体2及其启动子区DNA高甲基化的具体机制。方法:体外培养小鼠胰岛β细胞株Min6,将其分为对照组(0μmol/L同型半胱氨酸)和同型半胱氨酸组(120μmol/L同型半胱氨酸)。干预细胞48 h后,采用免疫荧光和Western blot法检测2组细胞中凋亡相关蛋白Bax、Bcl-2、半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶3表达情况;Western blot法检测DNA甲基化相关蛋白DNMT1、DNMT3a的表达水平;实时荧光定量PCR检测两组细胞中肝配蛋白A型受体2 mRNA水平;Western blot检测肝配蛋白A型受体2的蛋白表达情况;巢式甲基化特异性PCR检测EphA2启动子区DNA甲基化水平。结果与结论:①与对照组相比,同型半胱氨酸组胰岛β细胞中凋亡相关蛋白Bax和半胱氨酰天冬氨酸特异性蛋白酶3表达明显升高,Bcl-2表达明显下降;肝配蛋白A型受体2的mRNA和蛋白表达水平明显下降(P<0.05);②与对照组相比,同型半胱氨酸组肝配蛋白A型受体2 DNA甲基化水平明显升高(P<0.05),同型半胱氨酸组胰岛β细胞中DNMT1蛋白表达明显增高(P<0.05);③提示肝配蛋白A型受体2 DNA高甲基化在同型半胱氨酸致胰岛β细胞凋亡中的作用明显,而DNMT1可能参与其高甲基化过程。

摘要： 肺癌是严重威胁人类生命健康的恶性肿瘤之一。DNA甲基化作为表观遗传学的主要组成部分,其在细胞增殖、凋亡、DNA修复、肿瘤侵袭和转移等生物过程中起着重要作用。大量研究证明,DNA甲基化在肺癌的发展中扮演着重要的角色,本文就近年来DNA甲基化在肺癌中的发病机制、诊断、治疗及预后的研究进展作一综述。

摘要： 急性髓系白血病(AML)的病因目前尚未完全阐明,研究发现其与异常的表观遗传学改变密切相关.DNA甲基化是由DNA甲基转移酶(DNMT)介导的表观遗传过程.DNMT由DNMT1、DNMT3A和DNMT3B组成,是高度保守的DNA修饰酶,其在表观遗传调控中发挥重要作用,并与AML的临床特征与治疗效果的关系十分密切.深入了解DNMT在AML中的作用,有助于阐明AML的发生机制,并为其临床治疗提供潜在的靶点.

摘要： 了解肿瘤组织的免疫细胞比例对肿瘤患者的诊断和预后治疗具有重要意义,DNA甲基化可以作为一种细胞分子特征来量化复杂肿瘤混合物中的多种细胞类型。本研究基于非负矩阵分解算法并结合部分DNA甲基化建立肿瘤浸润免疫细胞比例预测模型。在预测肿瘤混合物中细胞类型的比例时,选择已知的对每种免疫细胞类型差异显著的DNA甲基化水平矩阵作为特征矩阵,将其和肿瘤混合物的DNA甲基化水平输入到非负矩阵分解算法进行细胞类型的比例预测。噪声和肿瘤含量不同设置下的模拟实验验证了该模型预测的免疫细胞比例与真实比例具有很高的一致性,且均方根误差较小。将该模型应用到4种真实的肿瘤样本上,得到每种样本中浸润水平最高的免疫细胞,结果与之前其他学者的生物学发现相一致。本研究的模型能准确预测组成肿瘤混合物的细胞类型比例,为肿瘤的免疫学研究提供了新的方法。

摘要： 环指蛋白(RNF)180基因是一种抑癌基因,其表达水平受基因甲基化修饰的影响。RNF180基因编码产物具有E3泛素蛋白连接酶活性,参与机体细胞的生长、成熟、增殖及凋亡。目前,全球胃癌发病率及病死率较高,且尚缺乏高敏感性、高特异性的简便检测手段。外周血RNF180基因甲基化检测在胃癌早期诊断中的敏感性及特异性均较高,与肿瘤大小、TNM分期、分化程度相关,但目前对RNF180的认识尚不全面,进一步探索RNF180的作用机制、优化基因甲基化检测手段,可为胃癌早期筛查、诊断、靶向治疗、疗效评价、预后和复发监测提供新线索。

摘要： 为探讨哈维氏弧菌Vibrio harveyi感染对红鳍东方鲀Takifugu rubripes白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)基因DNA甲基化的影响,试验选用体质量为(100.5±10.8)g的红鳍东方鲀,设对照组和感染组(哈维氏弧菌浓度为10^(7) cfu/mL),鱼体在菌液中浸泡12 h后转移到无致病性病原的干净海水中继续饲养7 d,然后进行样品采集,检测红鳍东方鲀脾脏的病理变化、IL-6基因的相对表达量及其启动子区域DNA甲基化变化。结果表明:发病组红鳍东方鲀脾脏有大量坏死灶,未发病组无明显坏死灶;发病组脾脏IL-6 mRNA相对表达量显著高于对照组和未发病组(P0.05);未发病组IL-6基因启动子区域DNA甲基化水平明显高于发病组(P<0.05)。研究表明,哈维氏弧菌感染后,红鳍东方鲀表现出不同的抗病能力,且抗病能力不同的红鳍东方鲀在IL-6基因启动子区域DNA甲基化水平存在明显差异。

摘要： IgA肾病(IgA Nephropathy,IgAN)是目前最常见的原发性肾小球肾炎,是一种多基因参与的免疫相关性疾病。然而目前GWAS研究中关于IgAN的遗传易感位点仅能解释4~7%的疾病遗传度。有研究发现了表观遗传学在IgAN中的作用。表观遗传学是指DNA序列未发生变化,但生物体的表型发生了可遗传性的改变,其机制主要包括DNA甲基化、组蛋白甲基化、MicroRNA调控、染色质重塑等。本文就目前表观遗传学特别是DNA甲基化在IgA肾病中的研究进展做一综述。

摘要： 抑郁症是一种以情绪低落、兴趣减退为主要特征的精神障碍,严重危害人类健康和增加社会经济负担。主流观点认为抑郁症是基因与环境交互作用的结果,表观遗传完美地将两者联系在一起。DNA甲基化是最主要的表观遗传修饰之一,也是抑郁症中研究最多的表观遗传机制。本文对常见DNA甲基/去甲基化酶与抑郁症的关系,候选基因DNA甲基化与DNA甲基化组学在抑郁症中的表达模式以及DNA甲基化与抗抑郁治疗的研究进展进行综述,以期为抑郁症的诊断与治疗提供参考。

摘要： RNF180是具有泛素连接酶活性的一类环指蛋白,可通过参与泛素-蛋白酶体系统影响细胞增殖、分化及凋亡等多种生理过程。研究表明,RNF180在肿瘤中多呈低表达,可抑制胃癌细胞的增殖侵袭,影响胃癌淋巴结转移及预后。RNF180的启动子甲基化引起的基因表达沉默是导致RNF180蛋白在肿瘤中低表达的主要原因,重要甲基化位点与癌前病变、胃癌淋巴结转移及患者预后相关。故RNF180具有成为胃癌肿瘤生物标志物的潜力。

摘要： 优良砧木或接穗可以显著促进嫁接植物生长,提高其抗逆性及果实产量和品质,是一种绿色安全可持续的方法。文章综述了植物嫁接后砧木与接穗在养分和水分吸收、激素调节、应激响应、嫁接亲和性以及RNA长距离运输、DNA甲基化等方面的相互作用及基因表达的响应机制,可为后续深入研究砧穗互作机制提供借鉴。

摘要： 目的:探索RSK4在乳腺癌发病机制中的作用. 方法:运用RT-PCR法和Western Blot法检测乳腺癌组织和细胞中RSK4mRNA以及RSK4蛋白的表达;运用Western Blot检测乳腺癌细胞中AKT、ERK相关蛋白、E-cadherin和vimentin的表达;采用慢病毒转染的方法构建过表达RSK4的MDA-MB-231细胞;使用Transwell法检测乳腺癌细胞迁移和侵袭能力;对MDA-MB-231细胞及去甲基化处理的细胞进行DNA甲基化检测;建立裸鼠移植瘤模型来观察RSK4基因过表达后对裸鼠移植瘤生长及转移的影响. 结果:RSK4在乳腺癌组织和乳腺癌细胞系中的表达分别高于癌旁正常组织和乳腺正常细胞;过表达RSK4的MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力均降低,AKT和ERK蛋白的磷酸化形式以及vimentin的表达降低,E-cadherin的表达升高;RSK4在小鼠体内过表达明显抑制肿瘤生长. 结论:RSK4在乳腺癌中的低表达是由其启动子异常甲基化引起的;RSK4在乳腺癌的发展过程中起到抑制作用;RSK4参与乳腺癌的进展可能是由AKT和ERK信号通路介导的;RSK4可能调节乳腺癌细胞EMT过程.

摘要： 目的:探索RSK4在乳腺癌发病机制中的作用. 方法:运用RT-PCR法和Western Blot法检测乳腺癌组织和细胞中RSK4mRNA以及RSK4蛋白的表达;运用Western Blot检测乳腺癌细胞中AKT、ERK相关蛋白、E-cadherin和vimentin的表达;采用慢病毒转染的方法构建过表达RSK4的MDA-MB-231细胞;使用Transwell法检测乳腺癌细胞迁移和侵袭能力;对MDA-MB-231细胞及去甲基化处理的细胞进行DNA甲基化检测;建立裸鼠移植瘤模型来观察RSK4基因过表达后对裸鼠移植瘤生长及转移的影响. 结果:RSK4在乳腺癌组织和乳腺癌细胞系中的表达分别高于癌旁正常组织和乳腺正常细胞;过表达RSK4的MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力均降低,AKT和ERK蛋白的磷酸化形式以及vimentin的表达降低,E-cadherin的表达升高;RSK4在小鼠体内过表达明显抑制肿瘤生长. 结论:RSK4在乳腺癌中的低表达是由其启动子异常甲基化引起的;RSK4在乳腺癌的发展过程中起到抑制作用;RSK4参与乳腺癌的进展可能是由AKT和ERK信号通路介导的;RSK4可能调节乳腺癌细胞EMT过程.

摘要： 目的:探索RSK4在乳腺癌发病机制中的作用. 方法:运用RT-PCR法和Western Blot法检测乳腺癌组织和细胞中RSK4mRNA以及RSK4蛋白的表达;运用Western Blot检测乳腺癌细胞中AKT、ERK相关蛋白、E-cadherin和vimentin的表达;采用慢病毒转染的方法构建过表达RSK4的MDA-MB-231细胞;使用Transwell法检测乳腺癌细胞迁移和侵袭能力;对MDA-MB-231细胞及去甲基化处理的细胞进行DNA甲基化检测;建立裸鼠移植瘤模型来观察RSK4基因过表达后对裸鼠移植瘤生长及转移的影响. 结果:RSK4在乳腺癌组织和乳腺癌细胞系中的表达分别高于癌旁正常组织和乳腺正常细胞;过表达RSK4的MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力均降低,AKT和ERK蛋白的磷酸化形式以及vimentin的表达降低,E-cadherin的表达升高;RSK4在小鼠体内过表达明显抑制肿瘤生长. 结论:RSK4在乳腺癌中的低表达是由其启动子异常甲基化引起的;RSK4在乳腺癌的发展过程中起到抑制作用;RSK4参与乳腺癌的进展可能是由AKT和ERK信号通路介导的;RSK4可能调节乳腺癌细胞EMT过程.

摘要： 目的:探索RSK4在乳腺癌发病机制中的作用. 方法:运用RT-PCR法和Western Blot法检测乳腺癌组织和细胞中RSK4mRNA以及RSK4蛋白的表达;运用Western Blot检测乳腺癌细胞中AKT、ERK相关蛋白、E-cadherin和vimentin的表达;采用慢病毒转染的方法构建过表达RSK4的MDA-MB-231细胞;使用Transwell法检测乳腺癌细胞迁移和侵袭能力;对MDA-MB-231细胞及去甲基化处理的细胞进行DNA甲基化检测;建立裸鼠移植瘤模型来观察RSK4基因过表达后对裸鼠移植瘤生长及转移的影响. 结果:RSK4在乳腺癌组织和乳腺癌细胞系中的表达分别高于癌旁正常组织和乳腺正常细胞;过表达RSK4的MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力均降低,AKT和ERK蛋白的磷酸化形式以及vimentin的表达降低,E-cadherin的表达升高;RSK4在小鼠体内过表达明显抑制肿瘤生长. 结论:RSK4在乳腺癌中的低表达是由其启动子异常甲基化引起的;RSK4在乳腺癌的发展过程中起到抑制作用;RSK4参与乳腺癌的进展可能是由AKT和ERK信号通路介导的;RSK4可能调节乳腺癌细胞EMT过程.

摘要： 目的:探索RSK4在乳腺癌发病机制中的作用. 方法:运用RT-PCR法和Western Blot法检测乳腺癌组织和细胞中RSK4mRNA以及RSK4蛋白的表达;运用Western Blot检测乳腺癌细胞中AKT、ERK相关蛋白、E-cadherin和vimentin的表达;采用慢病毒转染的方法构建过表达RSK4的MDA-MB-231细胞;使用Transwell法检测乳腺癌细胞迁移和侵袭能力;对MDA-MB-231细胞及去甲基化处理的细胞进行DNA甲基化检测;建立裸鼠移植瘤模型来观察RSK4基因过表达后对裸鼠移植瘤生长及转移的影响. 结果:RSK4在乳腺癌组织和乳腺癌细胞系中的表达分别高于癌旁正常组织和乳腺正常细胞;过表达RSK4的MDA-MB-231细胞的迁移和侵袭能力均降低,AKT和ERK蛋白的磷酸化形式以及vimentin的表达降低,E-cadherin的表达升高;RSK4在小鼠体内过表达明显抑制肿瘤生长. 结论:RSK4在乳腺癌中的低表达是由其启动子异常甲基化引起的;RSK4在乳腺癌的发展过程中起到抑制作用;RSK4参与乳腺癌的进展可能是由AKT和ERK信号通路介导的;RSK4可能调节乳腺癌细胞EMT过程.

摘要： 炎症细胞因子网络的变化控制着炎症发生发展的方向,促炎症细胞因子网络和抗炎症细胞因子网络的动态平衡共同维持机体的炎症正常功能,一旦这个平衡被打破就会引起病理性炎症,而DNA甲基化作为现在研究最为成熟的表观遗传学修饰方法之一,可在不改变基因核苷酸序列的情况下影响基因的表达.本文主要从与炎症反应密切相关的促炎症细胞因子、抗炎症细胞因子及其DNA甲基化调控三方面进行综述,是在阐明部分炎症因子与DNA甲基化调控之间的联系.

摘要： 炎症细胞因子网络的变化控制着炎症发生发展的方向,促炎症细胞因子网络和抗炎症细胞因子网络的动态平衡共同维持机体的炎症正常功能,一旦这个平衡被打破就会引起病理性炎症,而DNA甲基化作为现在研究最为成熟的表观遗传学修饰方法之一,可在不改变基因核苷酸序列的情况下影响基因的表达.本文主要从与炎症反应密切相关的促炎症细胞因子、抗炎症细胞因子及其DNA甲基化调控三方面进行综述,是在阐明部分炎症因子与DNA甲基化调控之间的联系.

摘要： 炎症细胞因子网络的变化控制着炎症发生发展的方向,促炎症细胞因子网络和抗炎症细胞因子网络的动态平衡共同维持机体的炎症正常功能,一旦这个平衡被打破就会引起病理性炎症,而DNA甲基化作为现在研究最为成熟的表观遗传学修饰方法之一,可在不改变基因核苷酸序列的情况下影响基因的表达.本文主要从与炎症反应密切相关的促炎症细胞因子、抗炎症细胞因子及其DNA甲基化调控三方面进行综述,是在阐明部分炎症因子与DNA甲基化调控之间的联系.

摘要： 抑郁症是以情绪低落、悲观、认知和睡眠存在障碍为主要特征的一种情感精神障碍,其发病机制目前尚不清楚,主要的假说有单胺类神经递质,受体,下丘脑-垂体-肾上腺轴以及脑源性神经营养因子假说.近年来随着表观遗传学研究的深入,发现DNA以及相关基因的甲基化与抑郁症的发生发展有很大关联,对阐明抑郁症的发病机制和寻求新的治疗方法有一定意义.本文就表观遗传学DNA甲基化与抑郁症发病机制研究角度进行论述.

摘要： 抑郁症是以情绪低落、悲观、认知和睡眠存在障碍为主要特征的一种情感精神障碍,其发病机制目前尚不清楚,主要的假说有单胺类神经递质,受体,下丘脑-垂体-肾上腺轴以及脑源性神经营养因子假说.近年来随着表观遗传学研究的深入,发现DNA以及相关基因的甲基化与抑郁症的发生发展有很大关联,对阐明抑郁症的发病机制和寻求新的治疗方法有一定意义.本文就表观遗传学DNA甲基化与抑郁症发病机制研究角度进行论述.

摘要： 提供用于测定DNA样品中的基因组甲基化特征的方法。在某些方面中，所述方法可以用于确定受试者是否患有膀胱癌或其它泌尿道癌症或是否处于产生膀胱癌或其它泌尿道癌症的风险中。同样提供治疗这类受试者的方法。

摘要： 本发明公开了一种外用组合物，其包括：(a)来自稻属植物的植物分生组织条件营养培养基；(b)以相对于组分(a)足以提供灭菌或生物稳定疗效的量存在的防腐剂；以及(c)皮肤病学上可接受的赋形剂。当本发明的所述组合物局部用于哺乳动物细胞时，能够对DNA的表观遗传甲基化发挥作用，使得甲基化状态被调节以具有较年轻细胞的表观遗传状态的较多的特征和模式。

摘要： 本申请公开了一种DNA甲基化测序文库及制备方法和DNA甲基化检测方法。本申请在建立测序文库时采用全甲基化的dNTP对双链DNA进行末端修复，然后利用酶转化和PCR扩增来建立DNA甲基化测序文库，因此，本申请能够避免仅采用未甲基化的dNTP进行末端修复时所带来的测序数据冗余现象。另外，末端修复后所引入的甲基化水平很容易从甲基化检测结果中进行剔除，故本申请虽然进行了末端修复，但是最终不会产生由于末端修复而导致的甲基化信息干扰，从而不会造成甲基化水平失真现象。

摘要： 提供用于测定DNA样品中的基因组甲基化特征的方法。在某些方面中，所述方法可以用于确定受试者是否患有膀胱癌或其它泌尿道癌症或是否处于产生膀胱癌或其它泌尿道癌症的风险中。同样提供治疗这类受试者的方法。

摘要： 本发明的课题在于提供能够简便地进行甲基化DNA的扩增和使用了该扩增的DNA的甲基化判定以及癌症判定的方法。本发明涉及“甲基化的分析对象区域的扩增方法、分析对象区域的甲基化判定方法、甲基化判定用试剂、癌症的判定方法、获得用于进行癌症的判定的数据的方法、癌症的判定用试剂和用于进行癌症的判定的标志物”。

摘要： 提供用于测定DNA样品中的基因组甲基化特征的方法。在某些方面中，所述方法可以用于确定受试者是否患有膀胱癌或其它泌尿道癌症或是否处于产生膀胱癌或其它泌尿道癌症的风险中。同样提供治疗这类受试者的方法。

摘要： 本发明公开了一种外用组合物，其包括：(a)来自稻属植物的植物分生组织条件营养培养基；(b)以相对于组分(a)足以提供灭菌或生物稳定疗效的量存在的防腐剂；以及(c)皮肤病学上可接受的赋形剂。当本发明的所述组合物局部用于哺乳动物细胞时，能够对DNA的表观遗传甲基化发挥作用，使得甲基化状态被调节以具有较年轻细胞的表观遗传状态的较多的特征和模式。

摘要： 本发明提供了一种用于检测结核病的DNA甲基化标志物、诊断模型、甲基化探针和试剂盒，涉及医学检测技术领域，该DNA甲基化标志物包括以下3个甲基化区域中的一个或多个：chr3：195635643‑195636243、chr6：29691631‑29692475和chr11：65315205‑65315625。本发明通过检测以上3个甲基化区域中的一个或多个，能够对结核病具有强大的诊断能力，同时DNA甲基化作为生物标志物弥补了样品不稳定的局限性，反映了结核分枝杆菌与宿主之间的相互作用。本发明还提供了基于本发明的3个DNA甲基化区域通过Logistic回归和弹性网络回归方法构建而成的3DMRs诊断分类器，具有较高的灵敏度、特异性和曲线下面积(AUC)，对结核病具有强大的诊断能力。

摘要： 本发明公开了一种基于DNA甲基化水平数据的甲基化年龄评估方法。本发明构建甲基化年龄预测模型要求输入文件包含重要甲基化位点信息，所述重要甲基化位点为文献报道的和/或与年龄变化相关的基因区域内的甲基化位点。本发明实施例中将获得的验证集预测甲基化年龄与验证集样本已知时间年龄之间计算R‑square、MAE、MSE、RMSE，结果显示R‑square为0.855，表明通过使用重要位点构建的预测模型对待测样本的甲基化年龄进行预测，保留信息较全，得到的甲基化年龄预测值更准确，与真实时间年龄的符合程度更高。

摘要： 本发明提供了牛骨骼肌分化相关DNA去甲基化酶TET1的mRNA上m6A甲基化位点的鉴定方法，提供了鉴定TET1的m6A甲基化水平的引物序列和方法，根据m6A‑seq测序和m6A‑IP‑qPCR鉴定了TET1的m6A水平在成肌分化中的变化；通过m6A位点的同义突变改变TET1的m6A甲基化水平，证明了TET1的m6A甲基化具有影响骨骼肌分化的功能；提供了检测TET1受m6A甲基化修饰调控的方法，通过双荧光素酶报告系统和RIP实验证明TET1的表达受METTL3‑m6A‑YTHDF1的调控；提供了检测DNA甲基化影响m6A甲基化修饰的方法，证明了牛骨骼肌分化中DNA甲基化与RNA甲基化的互作。为m6A甲基化修饰调控肌肉生长发育的功能研究提供参考，鉴定了骨骼肌发育中的一种新的互作机制，为肉牛的定向选育提供了一种新的分子标记。