杨树EST-SSR标记的开发

张新叶; 宋丛文; 张亚东; 杨彦伶; 黄敏仁

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杨树EST-SSR标记的开发

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利用来自美洲黑杨及欧美杨的20 023条EST序列,进行EST-SSR标记开发研究.首先对这些EST序列进行序列拼接,然后在非重复序列中发现由二核苷酸至五核苷酸组成的SSR重复序列.共在10 816个非重复序列中发现1 604个序列含有SSR,占总非重复序列的14.8%.在发现的1 918个SSR重复序列中,二核苷酸重复是最丰富的重复类型,占总类型的62.3%.设计合成48对SSR引物,利用6个不同的杨树品种对其进行验证.结果约90%的引物获得扩增产物,58%的引物在6个不同杨树品种中产生多态性分离.另外,还对重复序列的数量及重复类型进行了讨论.

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来源
《林业科学》 |2009年第9期|53-59|共7页
作者
张新叶; 宋丛文; 张亚东; 杨彦伶; 黄敏仁;
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作者单位

湖北省林业科学研究院,武汉,430079;

湖北省林业科学研究院,武汉,430079;

湖北省林业科学研究院,武汉,430079;

湖北省林业科学研究院,武汉,430079;

南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室,南京,210037;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类树木遗传学;
关键词
杨树; 表达序列标签(EST); 简单重复序列(SSR);

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