Streptomyces sp.DJ菌株产生的角蛋白酶的序列分析

柯野; 杨家臣; 屈奇奇; 袁小枚; 黄镜如

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Streptomyces sp.DJ菌株产生的角蛋白酶的序列分析

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[目的]解析Streptomyces sp.DJ菌株编码的3种角蛋白酶的氨基酸序列、二级结构、三级结构及其功能的关系.[方法]基于 DJ菌株全基因组测序结果,利用 Bio-edit、DNAMAN、Discovery Studio2.5等软件、https://swissmodel.expasy.org/等网站对其3种角蛋白酶的序列和结构进行了分析和预测.[结果]DJ菌株胞外分泌3种角蛋白酶(K1、K2和K3)均属于S8家族的丝氨酸蛋白酶,信号肽、前导肽和成熟肽在氨基酸残基的组成、极性和长度等方面较一致.3种酶均能以5WSL.1.A为模板进行同源建模,每种酶的3-D结构中均含有6个α螺旋、2个310α螺旋和15个β折叠的二级结构;其中K1酶含有2个二硫键,1Ca和2Ca位点,K2和K3各有1个二硫键,1Ca位点;3种酶的Pro270残基位于loop环,而仅有K2的Pro242残基位于loop环中.3种酶底物结合区域主要由疏水性残基构成,偏向于疏水性强的底物.3种酶的底物结合区域比较而言,S1和S2对底物特异性起关键作用;由于3种酶的S1和S2中重要位点残基的不保守性,使其底物特异性具有差异.[结论]DJ菌株中3种角蛋白酶在氨基酸、二硫键、脯氨酸和钙结合等的不同致使酶稳定性的不同;并且由于其表面电荷分布、底物结合区域的差异构成对羽毛水解位点的互补性,这可能是DJ菌株高效降解羽毛的重要原因.

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来源
《西南农业学报》 |2021年第10期|2274-2280|共7页
作者
柯野; 杨家臣; 屈奇奇; 袁小枚; 黄镜如;
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作者单位

韶关学院英东生物与农业学院广东韶关 512005;

韶关学院英东生物与农业学院广东韶关 512005;

韶关学院英东生物与农业学院广东韶关 512005;

韶关学院英东生物与农业学院广东韶关 512005;

韶关学院英东生物与农业学院广东韶关 512005;

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正文语种 chi
中图分类应用微生物学;
关键词
Streptomyces sp.DJ菌株; 全基因组测序; 角蛋白酶; 序列分析;

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