‘申鸿七彩雉鸡’mtDNA全基因组序列测序和系统发育关系分析

陈芳; 覃健峰; 郑德滨; 袁红艳; 吴琼

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‘申鸿七彩雉鸡’mtDNA全基因组序列测序和系统发育关系分析

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为了从分子角度解析‘申鸿七彩雉鸡'种群遗传背景,本研究采用PCR测序方法,对3个个体申‘鸿七彩雉鸡'的线粒体全基因组进行测序,并与NCBI公布的7条雉鸡线粒体基因组序列比对,构建系统进化树。获得‘申鸿七彩雉鸡'线粒体全基因组序列全长为16 685 bp,结构为典型的环状双链,包括13个蛋白质编码基因、2个rRNA、22个tRNA和D-Loop区。蛋白编码基因总长度为11 369 bp,基因重叠有7处,间隔有20处;D-loop序列长为1 148 bp,占整个基因的6.88%;tRNA基因长度为65~78 nt。'申鸿七彩雉鸡'线粒体全基因组、蛋白质编码基因、tRNA、rRNA和D-Loop区碱基组成中AT含量均大于CG含量。构建的进化树发现,'申鸿七彩雉鸡'和‘甘肃亚种雉鸡'聚为一类。

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来源
《特产研究》 |2022年第2期|25-30|共6页
作者
陈芳; 覃健峰; 郑德滨; 袁红艳; 吴琼;
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作者单位

龙岩学院生命科学学院;

上海欣灏珍禽育种有限公司;

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原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类观赏动物;
关键词
‘申鸿七彩雉鸡’; 线粒体全基因组; 系统发育关系;

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