基于枇杷转录组序列的SSR分子标记引物开发

郑婷婷; 魏伟淋; 杨向晖; 林顺权

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基于枇杷转录组序列的SSR分子标记引物开发

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为获得更多的枇杷SSR引物,对枇杷转录组测序得到的1kb以上的11 798条Unigenes进行SSR位点搜索.结果在3515条Unigenes (6.77％)中共获得4438个SSR位点,其中主要重复类型为双碱基重复和三碱基重复,二者占SSR总数的68.27％,而四、五、六碱基重复类型较少,仅占1.42％.对选出的SSR标记采用Primer3进行引物设计,得到7911对SSR位点特异引物,可用于枇杷遗传多样性分析、分子标记辅助育种、育种群体的建立等研究.

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来源
《亚热带植物科学》 |2015年第4期|274-278|共5页
作者
郑婷婷; 魏伟淋; 杨向晖; 林顺权;
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作者单位

华南农业大学园艺学院,广东广州510642;

上饶市森林资源监测中心,江西上饶334000;

华南农业大学园艺学院,广东广州510642;

华南农业大学园艺学院,广东广州510642;

华南农业大学园艺学院,广东广州510642;

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正文语种 chi
中图分类枇杷;
关键词
枇杷; 转录组; SSR;

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