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杜仲EuACOTS基因家族的鉴定及生物信息学分析

         

摘要

乙酰CoA酰基转移酶(acetylCoA Cacetyltransferase,ACOT)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)途径的起始酶,为了揭示生物合成杜仲胶的机制,对杜仲ACOTS基因家族进行全面的生物信息学分析.EuACOTS家族含有3个基因,分别记为EuACOT8、EuACOT9、EuACOT10.对其氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性以及同源进化等性质进行了分析,结果发现EuACOTS蛋白质的性质结构均较为相似,均存在2个硫解酶的特异保守序列,均属于稳定的疏水蛋白,无明显的跨膜区.在对EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件潜在功能的预测分析中发现,EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件进行比较发现启动子作用既有保守性,又有特异性,其中EuA CO TS家族含有大量基本顺式作用元件TATAbox,CAATbox以及光(AE-box、Box I、MNF1)、乙烯(ERE)、真菌诱导(Box-W1)和脱落酸(ABRE)等多个顺式调控元件.

著录项

  • 来源
    《经济林研究》 |2013年第4期|1-8|共8页
  • 作者

    乌云塔娜; 王淋; 叶生晶;

  • 作者单位

    中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州450003;

    国家林业局杜仲工程技术研究中心,河南郑州450003;

    中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙 410004;

    中南林业科技大学林学院,湖南长沙 410004;

    国家林业局中南林业调查规划设计院,湖南长沙410014;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类 遗传育种;
  • 关键词

    杜仲; 乙酰CoA; 酰基转移酶; 生物信息学;

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