金山区柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

董兆鹏; 孙箐爽; 臧昊; 王唐; 蔡光; 宋灿磊; 李淑华

首页> 中文期刊> 《浙江预防医学》 >金山区柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

金山区柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

开具论文收录证明 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

目的分析上海市金山区2017—2018年分离的柯萨奇病毒A组6型（Cox A6） VP1基因特征和氨基酸位点突变,为手足口病防控提供依据。方法对金山区2017—2018年采集并分离到16株Cox A6分离株VP1全长基因进行扩增、测序、序列比对,构建系统发生树,分析核苷酸和氨基酸同源性以及氨基酸位点突变。结果金山区16株Cox A6分离株均属于E2亚型同一个进化分支,16株间VP1基因核苷酸同源性为92.3%～97.7%,氨基酸同源性为98.4%～100.0%。与金山区16株分离株同源性最高的是2018年山东分离株MK357081/CHN/SD/JN/2018,核苷酸和氨基酸同源性分别为95.7%～99.3%和98.7%～99.7%。13株Cox A6分离株VP1氨基酸序列存在氨基酸位点变异,涉及8个氨基酸变异位点,但在抗原表位重要位点201D、243H、245R、247Y、248M和249R均未检测到抗原漂移。结论 16株Cox A6分离株核苷酸和氨基酸序列高度同源且位于E2亚型同一进化分支;Cox A6 E2亚型可能是金山区2017—2018年流行的主导基因型,金山区Cox A6 VP1存在氨基酸突变位点但未涉及关键的抗原表位。

著录项

来源
《浙江预防医学》 |2019年第11期|1136-1139|共4页
作者
董兆鹏; 孙箐爽; 臧昊; 王唐; 蔡光; 宋灿磊; 李淑华;
展开▼
作者单位

上海市金山区疾病预防控制中心;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类 R373.23;
关键词
柯萨奇病毒A组6型; VP1基因; 系统发育分析; 同源性分析; 抗原表位;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 中国大陆地区柯萨奇病毒A组4型VP1区基因特征分析 [J] . 姚学君 ,姜仁杰 ,管书慧 . 中国人兽共患病学报 . 2018,第011期
2. 柯萨奇病毒B组3型基因组剪切片段的序列分析 [J] . 汪颖楠 ,依鸣 ,徐维祯 . 微生物与感染 . 2020,第004期
3. 表达红色荧光蛋白重组柯萨奇病毒B组3型基因组稳定性分析 [J] . 赵文然 ,钟学宽 ,张淑娟 . 微生物与感染 . 2012,第001期
4. 柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析 [J] . 李琳琳 ,何雅晴 ,朱俊萍 . 病毒学报 . 2005,第3期
5. 2011—2016年上海地区手足口病病原谱及柯萨奇病毒A组6型不同基因型感染细胞的差异研究 [J] . 张晓玲 ,俞慧菊 ,刘祎 . 微生物与感染 . 2018,第002期
6. 2008年柯萨奇病毒A组16型北京地区分离株全基因组序列分析 [C] . 姚昕 ,王军志 ,毛群颖 . 2010年中国药学大会暨第十届中国药师周大会 . 2010
7. 中国手足口病中柯萨奇病毒A16流行株全基因组特征分析 [A] . 徐莉 . 2019

金山区柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅