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Opinion: Strategy of Semi-Automatically Annotating a Full-Text Corpus of Genomics Informatics

机译：意见：半自动注释基因组和信息学全文语料库的策略

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摘要

There is a communal need for an annotated corpus consisting of the full texts of biomedical journal articles. In response to community needs, a prototype version of the full-text corpus of Genomics & Informatics, called GNI version 1.0, has recently been published, with 499 annotated full-text articles available as a corpus resource. However, GNI needs to be updated, as the texts were shallow-parsed and annotated with several existing parsers. I list issues associated with upgrading annotations and give an opinion on the methodology for developing the next version of the GNI corpus, based on a semi-automatic strategy for more linguistically rich corpus annotation.
机译：共同需要带注释的语料库，该带注释的语料库由生物医学期刊文章的全文组成。为响应社区的需求，最近已发布了基因组学和信息学全文语料库的原型版本，称为GNI版本1.0，其中有499条带注释的全文文章作为语料库资源提供。但是，GNI需要更新，因为文本是浅层解析的，并带有多个现有解析器的注释。我列出了与升级注解相关的问题，并对基于下一版本的GNI语料库的开发方法提出了意见，该方法基于语言更加丰富的语料库注解的半自动策略。

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