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A community resource for high-throughput quantitative RT-PCR analysis of transcription factor gene expression in Medicago truncatula

机译：Medi藜转录因子基因表达高通量定量RT-PCR分析的社区资源

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BackgroundMedicago truncatula is a model legume species that is currently the focus of an international genome sequencing effort. Although several different oligonucleotide and cDNA arrays have been produced for genome-wide transcript analysis of this species, intrinsic limitations in the sensitivity of hybridization-based technologies mean that transcripts of genes expressed at low-levels cannot be measured accurately with these tools. Amongst such genes are many encoding transcription factors (TFs), which are arguably the most important class of regulatory proteins. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (qRT-PCR) is the most sensitive method currently available for transcript quantification, and one that can be scaled up to analyze transcripts of thousands of genes in parallel. Thus, qRT-PCR is an ideal method to tackle the problem of TF transcript quantification in Medicago and other plants.
机译：背景梅花苜蓿是一种豆科植物模型物种，目前是国际基因组测序工作的重点。尽管已经为该物种的全基因组转录本分析生产了几种不同的寡核苷酸和cDNA阵列，但基于杂交技术的敏感性的内在局限性意味着无法使用这些工具准确测量以低水平表达的基因的转录本。这些基因中有许多编码转录因子（TFs），可以说是最重要的调节蛋白。定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）是目前可用于转录本定量的最灵敏方法，并且可以扩大规模以并行分析数千个基因的转录本。因此，qRT-PCR是解决苜蓿和其他植物中TF转录物定量问题的理想方法。

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