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首页> 美国卫生研究院文献>Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America >Atypical regions in large genomic DNA sequences.
【2h】

Atypical regions in large genomic DNA sequences.

机译：大基因组DNA序列中的非典型区域。

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Large genomic DNA sequences contain regions with distinctive patterns of sequence organization. We describe a method using logarithms of probabilities based on seventh-order Markov chains to rapidly identify genomic sequences that do not resemble models of genome organization built from compilations of octanucleotide usage. Data bases have been constructed from Escherichia coli and Saccharomyces cerevisiae DNA sequences of > 1000 nt and human sequences of > 10,000 nt. Atypical genes and clusters of genes have been located in bacteriophage, yeast, and primate DNA sequences. We consider criteria for statistical significance of the results, offer possible explanations for the observed variation in genome organization, and give additional applications of these methods in DNA sequence analysis.
机译：大的基因组DNA序列包含具有独特序列结构模式的区域。我们描述了一种方法，该方法使用基于七阶马尔可夫链的概率对数来快速识别与通过八核苷酸用法的汇编建立的基因组组织模型不相似的基因组序列。已经从＞ 1000nt的大肠杆菌和啤酒酵母DNA序列和＞ 10,000nt的人序列构建了数据库。非典型基因和基因簇位于噬菌体，酵母和灵长类动物DNA序列中。我们考虑结果的统计显着性的标准，为观察到的基因组组织变异提供可能的解释，并提供这些方法在DNA序列分析中的其他应用。

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