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An efficiency analysis of high-order combinations of gene–gene interactions using multifactor-dimensionality reduction

机译:利用多维度降维对基因-基因相互作用的高阶组合进行效率分析

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摘要

BackgroundMultifactor dimensionality reduction (MDR) is widely used to analyze interactions of genes to determine the complex relationship between diseases and polymorphisms in humans. However, the astronomical number of high-order combinations makes MDR a highly time-consuming process which can be difficult to implement for multiple tests to identify more complex interactions between genes. This study proposes a new framework, named fast MDR (FMDR), which is a greedy search strategy based on the joint effect property.
机译:背景技术多维度降维(MDR)被广泛用于分析基因的相互作用,以确定人类疾病和多态性之间的复杂关系。但是,高阶组合的天文数字使MDR成为非常耗时的过程,对于多重测试以鉴定基因之间更复杂的相互作用而言,可能很难实施。这项研究提出了一个新的框架,称为快速MDR(FMDR),它是一种基于联合效应属性的贪婪搜索策略。

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