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ddSeeker: a tool for processing Bio-Rad ddSEQ single cell RNA-seq data

机译:ddSeeker:用于处理Bio-Rad ddSEQ单细胞RNA-seq数据的工具

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摘要

BackgroundNew single-cell isolation technologies are facilitating studies on the transcriptomics of individual cells. Bio-Rad ddSEQ is a droplet-based microfluidic system that, when coupled with downstream Illumina library preparation and sequencing, enables the monitoring of thousands of genes per cell. Sequenced reads show unique features that do not permit the use of freely available tools to perform single cell demultiplexing.
机译:背景技术新的单细胞分离技术正在促进对单个细胞转录组学的研究。伯乐(Bio-Rad)公司的ddSEQ是一个基于液滴的微流控系统,与下游Illumina文库的制备和测序相结合,可以监控每个细胞数千个基因。顺序读取显示出独特的功能,这些功能不允许使用免费的工具执行单单元解复用。

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