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Power in pairs: assessing the statistical value of paired samples in tests for differential expression

机译:配对功效:评估配对样本在差异表达测试中的统计价值

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摘要

BackgroundWhen genomics researchers design a high-throughput study to test for differential expression, some biological systems and research questions provide opportunities to use paired samples from subjects, and researchers can plan for a certain proportion of subjects to have paired samples. We consider the effect of this paired samples proportion on the statistical power of the study, using characteristics of both count (RNA-Seq) and continuous (microarray) expression data from a colorectal cancer study.
机译:背景技术当基因组学研究人员设计出高通量研究以测试差异表达时,一些生物学系统和研究问题为使用受试者配对样品提供了机会,并且研究人员可以计划一定比例的受试者进行配对样品。我们使用来自结直肠癌研究的计数(RNA-Seq)和连续(微阵列)表达数据的特征,来考虑此配对样本比例对研究统计能力的影响。

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