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Inferring topology from clustering coefficients in protein-protein interaction networks

机译:从蛋白质-蛋白质相互作用网络中的聚类系数推断拓扑

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摘要

BackgroundAlthough protein-protein interaction networks determined with high-throughput methods are incomplete, they are commonly used to infer the topology of the complete interactome. These partial networks often show a scale-free behavior with only a few proteins having many and the majority having only a few connections. Recently, the possibility was suggested that this scale-free nature may not actually reflect the topology of the complete interactome but could also be due to the error proneness and incompleteness of large-scale experiments.
机译:背景技术尽管通过高通量方法确定的蛋白质-蛋白质相互作用网络不完整,但它们通常用于推断完整相互作用组的拓扑结构。这些部分网络通常表现出无标度的行为,只有少数具有许多蛋白质,而大多数只有少数连接。最近,有人提出这种无标度的性质可能实际上并不能反映完整的相互作用组的拓扑结构,但也可能是由于大规模实验的错误倾向和不完整性所致。

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