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【2h】

Transcriptomic data indicating differential expressed genes between HIV-1 Associated Nephropathy (HIVAN) mouse model (Tg26) and wildtype mice

机译：转录组数据表明HIV-1相关性肾病（HIVAN）小鼠模型（Tg26）和野生型小鼠之间差异表达的基因

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Tg26 mice are robust models of human immunodeficiency virus 1 associated nephropathy (HIVAN). These mice are useful for HIVAN pathology analysis, and recent studies suggest that the Tg26 mouse model is an excellent model of other chronic kidney diseases. We performed RNA seq analysis of differential gene expression in the kidneys of Tg26 mice. Kidneys were collected from Tg26 mice and wildtype (WT) littermates at 3 months of age. The raw data were analyzed for differential gene expression using a negative binomial generalized linear model in the DeSeq2 software package. We used -Value ≤0.05 and an absolute fold change of 1.5 to identify top 50 upregulated and top 50 downregulated differentially expressed genes between the WT and Tg26 mice. As expected inflammatory genes were among the top differentially regulated genes. Our data provides yet another level of information to help gain a more comprehensive understanding of disease progression and identify potential drug targets for HIVAN and chronic kidney diseases.
机译：Tg26小鼠是人类免疫缺陷病毒1相关性肾病（HIVAN）的强大模型。这些小鼠可用于HIVAN病理分析，最近的研究表明Tg26小鼠模型是其他慢性肾脏疾病的出色模型。我们对Tg26小鼠肾脏中的差异基因表达进行了RNA seq分析。从3个月大的Tg26小鼠和野生型（WT）同窝幼仔中收集肾脏。使用DeSeq2软件包中的负二项式广义线性模型分析原始数据的差异基因表达。我们使用-Value≤0.05和绝对倍数变化为1.5来确定WT和Tg26小鼠之间表达最差的前50个基因和表达最差下调的前50个基因。不出所料，炎症基因是最差的调节基因之一。我们的数据提供了又一个级别的信息，以帮助您更全面地了解疾病进展并确定HIVAN和慢性肾脏病的潜在药物靶标。

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