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首页> 美国卫生研究院文献>Horticulture Research >Bioinformatic analysis of chromatin organization and biased expression of duplicated genes between two poplars with a common whole-genome duplication
【2h】

Bioinformatic analysis of chromatin organization and biased expression of duplicated genes between two poplars with a common whole-genome duplication

机译：染色质组织的生物信息分析两种杨树与常见全基因组重复的两种杨树偏置基因的表达

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The heatmaps at the top are Hi-C contact maps at 50-kb resolution, which show global patterns of chromatin interaction in the chromosome. The chromosome is shown from top to bottom and left to right. The ICE-normalized interaction intensity is shown on the color scale on the right side of the heatmap. The track below the Hi-C heatmap shows the partition of A (red histogram, PC1 > 0) and B (green histogram, PC1 < 0) compartments as characterized by PCA. CG (yellow curve), CHG (gray curve), and CHH (red curve) methylation modification levels along the chromosome are plotted immediately below the compartment partition track. The heatmap at the bottom shows the density of repeat sequences along the chromosome
机译：顶部的热量是50-kB分辨率的Hi-C接触图，其显示染色体中的染色质相互作用的全局模式。染色体从上到下显示，左右。冰归一化的相互作用强度显示在热图右侧的颜色刻度上。 Hi-C Heatmap下方的轨道显示（红色直方图，PC1> 0）和B（绿色直方图，PC1 <0）隔间的分区，如PCA所表征。 CG（黄色曲线），CHG（灰色曲线）和沿染色体的甲基化修饰水平绘制在隔室分区轨道下方。底部的热线图显示了染色体重复序列的密度

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