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首页> 美国卫生研究院文献>Mitochondrial DNA. Part B Resources >Complete chloroplast genome of Cerasus kumanoensis (Rosaceae) a wild flowering cherry endemic to Kii Peninsula Japan
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Complete chloroplast genome of Cerasus kumanoensis (Rosaceae) a wild flowering cherry endemic to Kii Peninsula Japan

机译：Cerasus Kumanensis（Rosaceae）的完全叶绿体基因组野生开花樱桃特有到日本猕猴桃

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Cerasus kumanoensis is a recently described wild cherry species from the Kii Peninsula, Japan. Here we determined the first complete chloroplast genome of C. kumanoensis using genome skimming approach. The cp genome was 157,898 bp long, with a large single-copy region (LSC) of 85,926 bp and a small single-copy region (SSC) of 19,070 bp separated by a pair of inverted repeats (IRs) of 26,451 bp. It encodes 129 genes, including 84 protein-coding genes, 37 tRNA genes, and 8 ribosomal RNA genes. Besides, we reconstructed the phylogeny of Prunus using maximum likelihood (ML) method, including our data and previously reported cp genomes of related taxa. The phylogenetic analysis indicated that C. kumanoensis is close related with a group including Prunus takesimensis and P. speciosa.
机译：Cerasus Kumanoensis是最近描述了日本Kii半岛的野生樱桃种。在这里，我们使用基因组撇脱方法确定了C.Kumanoensis的第一个完整的叶绿体基因组。 CP基因组为157,898bp长，具有85,926bp的大单拷贝区域（LSC）和19,070bp的小单拷贝区域（SSC），由一对反相的重复（IRS）为26,451 bp。它编码129个基因，包括84个蛋白质编码基因，37个TRNA基因和8个核糖体RNA基因。此外，我们使用最大可能性（mL）方法重建李丘的系统发育，包括我们的数据和先前报告的相关分类群的CP基因组。系统发育分析表明，C.Kumanoensis与包括蛋白培养米斯和P. Speciosa的组有关。

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