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The complete chloroplast genome sequence of Rosa laevigata (Rosaceae)

机译:Rosa Laevigata(Rosaceae)的完整叶绿体基因组序列

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摘要

The complete chloroplast genome of Rosa laevigata has been characterized by reference-based assembly using Illumina paired-end data. The complete cp genome is 156,342 bp in length, containing a large single-copy region of 85,459 bp, a small single-copy region of 18,785 bp, which are separated by a pair of inverted repeat regions of 26,049 bp, a total of 140 genes were predicted from the cp genome, including 87 protein-coding genes, 39 tRNA genes, and 8 rRNA genes . Most genes occur as a single copy, while 19 gene species are duplicated. Phylogenetic analysis reveals that R. laevigata and Rosa roxburghii f. normalis are more closely related to each other than either is to Rosa banksiae var. normalis.
机译:Rosa Laevigata的完整叶绿体基因组在使用Illumina配对的数据的基础组件的特征是。完整的CP基因组长度为156,342bp,含有大量的单拷贝区域为85,459 bp,小单拷贝区域为18,785 bp,由一对反相的重复区域分开,共140个基因。从CP基因组预测,包括87个蛋白质编码基因,39个TRNA基因和8个RRNA基因。大多数基因作为单一拷贝进行,而19个基因物种是复制的。系统发育分析显示,R. Laevigata和Rosa Roxburghii F.难以彼此密切相关,而不是罗莎库尔西亚var。难以置信。

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