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MOLA: a bootable self-configuring system for virtual screening using AutoDock4/Vina on computer clusters

机译:MOLA:一种可启动的自我配置系统用于在计算机群集上使用AutoDock4 / Vina进行虚拟筛选

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摘要

BackgroundVirtual screening of small molecules using molecular docking has become an important tool in drug discovery. However, large scale virtual screening is time demanding and usually requires dedicated computer clusters. There are a number of software tools that perform virtual screening using AutoDock4 but they require access to dedicated Linux computer clusters. Also no software is available for performing virtual screening with Vina using computer clusters. In this paper we present MOLA, an easy-to-use graphical user interface tool that automates parallel virtual screening using AutoDock4 and/or Vina in bootable non-dedicated computer clusters.
机译:背景技术使用分子对接技术对小分子进行虚拟筛选已成为药物发现中的重要工具。但是,大规模的虚拟筛查需要时间,并且通常需要专用的计算机集群。有许多软件工具可以使用AutoDock4执行虚拟筛选,但是它们需要访问专用的Linux计算机集群。同样,没有可用的软件来使用计算机集群对Vina进行虚拟筛选。在本文中,我们介绍了MOLA,这是一种易于使用的图形用户界面工具,可在可启动的非专用计算机集群中使用AutoDock4和/或Vina自动执行并行虚拟筛选。

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