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Prediction and systematic study of protein-protein interaction networks of Leptospira interrogans

机译：钩端螺旋体蛋白-蛋白相互作用网络的预测和系统研究

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Leptospira interrogans serovar Lai is a pathogenic bacterium that causes a spirochetal zoonosis in humans and some animals. With its complete genome sequence available, it is possible to analyze protein-protein interactions from a whole-genome standpoint. Here we combine four recently developed computational approaches (gene fusion method, gene neighbor method, phylogenetic profiles method, and operon method) to predict protein-protein interaction networks of Leptospira interrogans strain Lai. Through comprehensive analysis on interactions among proteins of motility and chemotaxis system, signal transduction, lipopolysaccaride biosynthesis and a series of proteins related to adhesion and invasion, we provided information for further studying on its pathogenic mechanism. In addition, we also assigned 203 previously uncharacterized proteins with possible functions based on the known functions of its interacting partners. This work is helpful for further investigating L interrogans strain Lai.
机译：钩端螺旋体血清型赖氨酸是一种致病性细菌，可引起人类和某些动物的螺旋形人畜共患病。利用其完整的基因组序列，可以从全基因组的角度分析蛋白质之间的相互作用。在这里，我们结合四种最新开发的计算方法（基因融合方法，基因邻域方法，系统发育谱方法和操纵子方法）来预测问号钩端螺旋体Lai的蛋白质-蛋白质相互作用网络。通过对运动蛋白与趋化系统蛋白，信号转导，脂多糖的生物合成以及一系列与粘附和侵袭有关的蛋白之间的相互作用的综合分析，为进一步研究其致病机理提供了信息。此外，我们还基于其相互作用伙伴的已知功能为203个以前未表征的蛋白分配了可能的功能。这项工作有助于进一步调查问号L赖氏菌株。

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