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Secondary Metabolome and Transcriptome of Streptomyces albus J1074 in Liquid Medium SG2

机译：液体培养基SG2中链霉菌和霉菌的二态代谢物和转录组

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Streptomyces albus J1074 is one of the most popular chassis for heterologous expression of actino-bacterial biosynthetic gene clusters (BGCs). Considerable efforts are invested into understanding all the physiological and genetic aspects of secondary metabolism of J1074 in order to maximize the expression of heterologous BGCs. It has to be noted that the J1074 genome itself is home to numerous ( 20) BGCs, whose expression varies widely. Therefore, the identification of the factors limiting the expression of J1074 BGCs might help improve this strain for heterologous expression purposes. As first steps towards this goal, herein we describe the secondary metabolome of J1074 in liquid medium SG2, previously shown by us to support the production of antibacterial and antifungal compounds. We compare the results of metabolomic studies with the transcriptome of J1074 in SG2 after 60 h of growth. Results of our studies are discussed in the context of current knowledge on the J1074 transcriptome and metabolome data.
机译：Streptomyces Albus J1074是用于异源细菌生物合成基因簇（BGCS）的异源表达最受欢迎的底盘之一。对J1074的次级代谢的所有生理和遗传方面进行了相当大的努力，以最大化异源BGC的表达。必须注意的是，J1074基因组本身是许多（> 20）BGC的所在地，其表达方式广泛变化。因此，限制J1074 BGCs表达的因素的鉴定可能有助于改善这种菌株的异源表达目的。作为朝向该目标的第一步，这里我们描述了J1074在液体培养基SG2中的次级代谢组，以前通过我们所示以支持抗菌和抗真菌化合物的产生。我们在60小时后与J1074的转录组比较了代谢组研究的结果。在目前关于J1074转录组和代谢数据的知识的背景下讨论了我们研究的结果。

著录项

  • 来源
    《Cytology and genetics》 |2019年第1期|1-7|共7页
  • 作者

    Koshla O. T.; Rokytskyy I. V.; Ostash I. S.; Busche T.; Kalinowski J.; Moesker E.; Suessmuth R. D.; Fedorenko V. O.; Ostash B. O.;

  • 作者单位

    Ivan Franko Natl Univ Lviv Dept Genet & Biotechnol UA-79005 Lvov Ukraine;

    Ivan Franko Natl Univ Lviv Dept Genet & Biotechnol UA-79005 Lvov Ukraine;

    Ivan Franko Natl Univ Lviv Dept Genet & Biotechnol UA-79005 Lvov Ukraine;

    Bielefeld Univ Technol Platform Genom D-33615 Bielefeld Germany;

    Bielefeld Univ Technol Platform Genom D-33615 Bielefeld Germany;

    Tech Univ Berlin Inst Chem D-10623 Berlin Germany;

    Tech Univ Berlin Inst Chem D-10623 Berlin Germany;

    Ivan Franko Natl Univ Lviv Dept Genet & Biotechnol UA-79005 Lvov Ukraine;

    Ivan Franko Natl Univ Lviv Dept Genet & Biotechnol UA-79005 Lvov Ukraine;

  • 收录信息
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  • 正文语种 eng
  • 中图分类
  • 关键词

    Streptomyces albus J1074; secondary metabolism; RNA-seq;

    机译：Streptomyces Albus J1074;次生新陈代谢;RNA-SEQ;

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