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首页> 外文期刊>Clinical epigenetics. >Epigenomic profiling of archived FFPE tissues by enhanced PAT-ChIP (EPAT-ChIP) technology
【24h】

Epigenomic profiling of archived FFPE tissues by enhanced PAT-ChIP (EPAT-ChIP) technology

机译：通过增强的PAT-ChIP（EPAT-ChIP）技术对已归档的FFPE组织进行表观基因组分析

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BackgroundThe introduction of pathology tissue-chromatin immunoprecipitation (PAT-ChIP), a technique allowing chromatin immunoprecipitation (ChIP) from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues, has extended the application of chromatin studies to clinical patient samples. However, extensive crosslinking introduced during routine tissue fixation of clinical specimens may hamper the application of PAT-ChIP to genome-wide studies (PAT-ChIP-Seq) from archived tissue samples. The reduced efficiency in chromatin extraction from over-fixed formalin archival samples is the main hurdle to overcome, especially when low abundant epigenetic marks (e.g., H3K4me3) are investigated.
机译：背景技术病理组织染色质免疫沉淀（PAT-ChIP）的引入是一种允许从福尔马林固定的石蜡包埋（FFPE）组织中进行染色质免疫沉淀（ChIP）的技术，将染色质研究的应用范围扩展到了临床患者样品中。但是，在常规的临床标本组织固定过程中引入的大量交联可能会阻碍PAT-ChIP在来自存档组织样本的全基因组研究（PAT-ChIP-Seq）中的应用。从过度固定的福尔马林档案样品中提取染色质的效率降低是需要克服的主要障碍，尤其是在调查低丰度表观遗传标记（例如H3K4me3）时。

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