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A Computational Strategy for Protein Function Assignment which Addresses the Multidomain Problem

机译：蛋白质功能分配的计算策略，解决了多域问题

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A method for assigning functions to unknown sequences based on finding correlations between short signals and functional annotations in a protein database is presented.This approach is based on keyword (KW) and feature (FT) information stored inthe SWISS-PROT database. The former refers to particular protein characteristicsand the latter locates these characteristics at a specific sequence position. In this way,a certain keyword is only assigned to a sequence if sequence similarity is found inthe position described by the FT field. Exhaustive tests performed over sequenceswith homologues (cluster set) and without homologues (singleton set) in the databaseshow that assigning functions is much ’cleaner’ when information about domains (FTfield) is used, than when only the keywords are used.
机译：提出了一种基于蛋白质数据库中短信号与功能注释之间的相关性为未知序列分配功能的方法，该方法基于存储在SWISS-PROT数据库中的关键字（KW）和特征（FT）信息。前者指的是特定的蛋白质特性，而后者则将这些特性定位在特定的序列位置。这样，只有在FT字段描述的位置发现序列相似性时，才将某个关键字分配给序列。对数据库中具有同源物（簇集）和没有同源物（单例集）的序列进行的详尽测试表明，使用域信息（FTfield）时，与仅使用关键字相比，分配功能要“干净”得多。

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