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Isolation and characterization of novel polymorphic microsatellite markers for the white stork, Ciconia ciconia: applications in individual–based and population genetics

机译:白鹳,Ciconia ciconia的新型多态微卫星标记的分离和表征:在基于个体的遗传和群体遗传学中的应用

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摘要

Aislamiento y caracterización de nuevos marcadores de microsatélites polimórficos para la cigüe?a blanca, Ciconia ciconia: aplicaciones de la genética basada en individuos y de poblaciones A pesar de que la cigüe?a blanca, Ciconia ciconia, es una especie modelo en estudios de migración y comportamiento, los marcadores moleculares publicados hasta ahora no son lo suficientemente polimórficos para poder realizar estudios genéticos basados en el individuo. Utilizando la secuenciación de nueva generación hemos seleccionado 11 marcadores polimórficos y los hemos utilizado en cigüe?as de dos localidades de estudio. El número medio de alelos por locus fue de 5,3 con un mínimo de dos y un máximo de 10. La heterocigosidad media observada y esperada fue de 0,519 y 0,565, respectivamente. La PID (probabilidad de identidad) resultó ser suficientemente sensible para los estudios sobre genética basada en individuos y genética de poblaciones. No hemos encontrado evidencias de pérdida alélica, alelos nulos ni ningún otro error y ningún locus estaba en desequilibrio de Hardy–Weinberg en ambas localidades a pesar de que dos loci sí que lo estuvieran en una única localidad. Estos marcadores son útiles para dar respuesta a una serie de preguntas relacionadas con la diversidad genética, el grado de filopatria y las estrategias genéticas de reproducción.↓Aislamiento y caracterización de nuevos marcadores de microsatélites polimórficos para la cigüe?a blanca, Ciconia ciconia: aplicaciones de la genética basada en individuos y de poblaciones A pesar de que la cigüe?a blanca, Ciconia ciconia, es una especie modelo en estudios de migración y comportamiento, los marcadores moleculares publicados hasta ahora no son lo suficientemente polimórficos para poder realizar estudios genéticos basados en el individuo. Utilizando la secuenciación de nueva generación hemos seleccionado 11 marcadores polimórficos y los hemos utilizado en cigüe?as de dos localidades de estudio. El número medio de alelos por locus fue de 5,3 con un mínimo de dos y un máximo de 10. La heterocigosidad media observada y esperada fue de 0,519 y 0,565, respectivamente. La PID (probabilidad de identidad) resultó ser suficientemente sensible para los estudios sobre genética basada en individuos y genética de poblaciones. No hemos encontrado evidencias de pérdida alélica, alelos nulos ni ningún otro error y ningún locus estaba en desequilibrio de Hardy–Weinberg en ambas localidades a pesar de que dos loci sí que lo estuvieran en una única localidad. Estos marcadores son útiles para dar respuesta a una serie de preguntas relacionadas con la diversidad genética, el grado de filopatria y las estrategias genéticas de reproducción.
机译:白鹳,Ciconia ciconia的新型多态微卫星标记的分离和表征:个体和基于群体的遗传学的应用尽管白鹳,Ciconia ciconia,是迁移研究中的模型物种在行为和行为上,迄今为止发表的分子标记物的多态性不足以进行基于个体的遗传研究。使用下一代测序,我们选择了11个多态性标记并将其用于来自两个研究地点的鹳。每个基因座的平均等位基因数为5.3,最少为两个,最多为10。观察到的和预期的杂合度分别为0.519和0.565。发现PID(同一性的概率)对于基于个体的遗传学和群体遗传学的研究足够敏感。我们没有发现等位基因缺失,无效等位基因或任何其他错误的证据,尽管两个位点都在一个位置,但在两个位置上的Hardy-Weinberg不平衡位点都没有。这些标记对于回答与遗传多样性,亲密程度和遗传育种策略有关的一系列问题非常有用↓分离和表征白鹳Ciconia ciconia的新多态微卫星标记:应用基于个体和种群的遗传学研究尽管白鹳Ciconia ciconia是迁移和行为研究的典范物种,但迄今为止发表的分子标记多态性不足以进行基于在个人。使用下一代测序,我们选择了11个多态性标记并将其用于来自两个研究地点的鹳。每个基因座的平均等位基因数量为5.3,最少为两个,最多为10。观察到的和预期的杂合度分别为0.519和0.565。发现PID(同一性的概率)对于基于个体的遗传学和群体遗传学的研究足够敏感。我们没有发现等位基因缺失,无效等位基因或任何其他错误的证据,尽管两个位点都在一个位置,但在两个位置上的Hardy-Weinberg不平衡位点都没有。这些标记物对于回答与遗传多样性,亲密程度和遗传育种策略有关的一系列问题很有用。

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