首页> 外文期刊>e-Jurnal Medika Udayana >VALIDASI TEKNIK NOVEL TRIPLEX ALLELE SPESIFIC PCR UNTUK MENDETEKSI POLIMORFISME -1082 G>A GEN IL-10 DAN -308 G>A GEN TNF?
【24h】

VALIDASI TEKNIK NOVEL TRIPLEX ALLELE SPESIFIC PCR UNTUK MENDETEKSI POLIMORFISME -1082 G>A GEN IL-10 DAN -308 G>A GEN TNF?

机译:TRIPLEK等位基因特异性PCR新型工程验证检测多态性-1082 G> IL-10基因和-308 G> TNF基因吗?

获取原文
           

摘要

Penyakit Dengue merupakan penyakit endemis di daerah tropis dan subtropis, dimana terdapat tempat-tempat wisata yang ramai dikunjungi. Hal ini menyebabkan wisatawan yang berkunjung rentan terkena infeksi. Setiap tahunnya terjadi infeksi virus Dengue sebanyak 50 juta dengan Dengue Hemorraghic Fever (DHF) sebanyak 500 ribu kasus dan jumlah kematian sebanyak 22.000 terutama pada anak-anak. Infeksi virus Dengue mengakibatkan gejala yang berspektrum dan dipengaruhi oleh umur, genetik host dan status viremia. Patogenesis terjadinya DHF belum diketahui sepenuhnya, namun beberapa studi mendukung peran sitokin dimana sitokin memperantai terjadinya kebocoran plasma. Sitokin yang mengalami perubahan ekspresi pada DHF utamanya adalah IL10 dan TNF?. Beberapa studi menunjukkan adanya variasi (polimorfisme) dalam region promoter mempengaruhi ekspresi. Namun penelitian-penelitian tersebut masih menggunakan teknik mendeteksi polimorfisme seperti PCR-RFLP dimana dapat dikatakan menghabiskan waktu dan biaya. Hal dapat dihitung dari banyaknya produk PCR yang diperlukan untuk proses restriksi serta perlunya reagen enzim restriksi itu tersebut. Oleh karenanya dipandang perlu dikembangkan teknik yang dapat mendeteksi varian tersebut dengan menggunakan PCR konvensional yang lebih terjangkau oleh negara berkembang. Teknik yang tepat untuk dikembangkan adalah duplex allele spesific PCR karena dapat menghindari kesalahan post-PCR yang dapat terjadi pada PCR-RFLP. Selain itu pada duplex allele spesific PCR sudah terdapat kontrol internal untuk menghindari adanya kesalahan internal saat proses amplifikasi. Teknik ini bersifat murah, cepat dan dapat diaplikasikan pada tempat dengan fasilitas terbatas. Design penelitian adalah uji diagnostik. Darah vena dari 16 anak dengan DHF dikumpulkan secara konsekutif, dilakukan isolasi DNA dan disekuensing sebagai baku standar. Kemudian dikembangkan design primer secara trial and error untuk menghasilkan duplex allele spesific PCR. Selanjutnya dilakukan analisis untuk melihat sensitivitas dan spesifisitas teknik novel duplex allele spesific PCR untuk mendeteksi polimorfisme -1082 G>A gen IL-10 dan -308 G>A gen TNF?.
机译:登革热病是热带和亚热带地区的地方病,那里的旅游景点非常拥挤。这导致来访的游客容易受到感染。每年有5000万登革热(DHF)登革热病毒感染,多达50万例,死亡人数多达22,000,特别是在儿童中。登革热病毒感染会引起一系列症状,并受到年龄,宿主遗传学和病毒血症状况的影响。 DHF的发病机理尚不完全清楚,但是有几项研究支持细胞因子的作用,其中细胞因子连锁发生血浆渗漏。发生DHF表达变化的主要细胞因子是IL10和TNFα。多项研究表明,启动子区域的变异(多态性)会影响表达。但是,这些研究仍然使用多态性检测技术,例如PCR-RFLP,可以说是耗时且昂贵的。这可以从限制过程所需的PCR产物数和限制酶试剂的需要量中计算得出。因此,认为有必要开发一种能够使用常规PCR检测这些变体的技术,该技术对于发展中国家而言更为经济。要开发的正确技术是PCR特异性双链体等位基因,因为它可以避免PCR-RFLP中可能发生的PCR后错误。此外,在PCR特异的双工等位基因中,存在内部对照以避免扩增过程中的内部错误。该技术便宜,快速并且可以在设施有限的地方使用。研究设计是一种诊断测试。连续收集16例DHF儿童的静脉血,分离DNA并测序作为标准标准品。然后通过反复试验开发出初步设计,以产生PCR特异性双链体等位基因。进行了进一步的分析,以观察新型双工等位基因特异性PCR技术检测-1082 G> A IL-10基因和-308 G> ATNFα基因多态性的敏感性和特异性。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱:kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备:11010802029741号 ICP备案号:京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有
  • 客服微信

  • 服务号