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【24h】

Apports de la génomique fonctionnelle à la cartographie fine de QTL

机译:功能基因组学对QTL精细定位的贡献

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摘要

De nombreux progrès ont été réalisés ces dernières années en génomique. Le développement de technologies à base de supports miniaturisés, permet aujourd’hui d’explorer les génomes tant au niveau de leur structure que de leur expression. Les puces à ADN permettent ainsi de génotyper plusieurs milliers de marqueurs SNP d’un génome ou encore de mesurer le niveau d’expression de plusieurs milliers de gènes d’un tissu. Combiner l’information génotypique avec des mesures phénotypiques élémentaires (ARNm, protéines ou encore métabolites) ouvre de nouvelles perspectives dans l’étude du fonctionnement du vivant et a donné naissance à un nouveau concept, la ? génétique génomique ?. Cet article est centré sur les apports de la ? génétique génomique ? dans le contexte de la détection de QTL (Quantitative Trait Locus). Après avoir défini la notion de QTL d’expression (eQTL), cet article propose dans un premier temps un bilan des différents programmes de cartographie de QTL d’expression décrits dans la littérature. Sont ensuite présentés les différentes méthodes utilisant des données d’expression pour préciser ou caractériser fonctionnellement des régions QTL responsables de la variation de caractères d’intérêt avec des exemples concernant les animaux d’élevage.
机译:近年来,基因组学已取得很大进展。基于小型化媒体的技术的发展现在使得有可能在基因组的结构和表达方面探索基因组。因此,DNA芯片可以对基因组中的数千个SNP标记进行基因分型或测量组织中数千个基因的表达水平。将基因型信息与基本表型测量(mRNA,蛋白质甚至代谢物)相结合,为研究活生物体的功能开辟了新的视角,并产生了一个新概念,即?遗传基因组学?本文重点介绍了什么?遗传基因组学?在QTL(定量性状基因座)检测的背景下。在定义了表达QTL(eQTL)概念之后,本文首先概述了文献中描述的不同表达QTL映射程序。接下来,以农场动物为例,介绍了使用表达数据来指定或功能表征引起关注性状变异的QTL区域的各种方法。

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