• 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文期刊>Gene Therapy and Molecular Biology >Glycine clock: Eubacteria first, Archaea next,Protoctista, Fungi, Planta and Animalia at last
【24h】

Glycine clock: Eubacteria first, Archaea next,Protoctista, Fungi, Planta and Animalia at last

机译：甘氨酸时钟：首先是真细菌，其次是古细菌，最后是Protoctista，真菌，植物和动物界

获取原文
           
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

Twenty-five different single-factor criteria and hypotheses about chronological order of appearance of amino acids in the early evolution are summarized in consensus ranking. All available knowledge and thoughts about origin and evolution of the genetic code are thus combined in a single list where the amino acids are ranked in descending order, starting with the earliest ones:G,A,D,V,P,S,E,L,T,I,N,F,H,K,R,Q,C,M,Y,WOne may expect that in the composition of the ancient proteins the earliest amino acids would dominate. Indeed, when homologous prokaryotic and eukaryotic protein sequences are aligned, the most frequent residue amongst matching amino acids (presumably, what remains of the common ancestor sequence) is glycine that makes about 14% vs. glycine content of 6-7% in modern proteins. The glycine content of the matching residues may, then, serve as a measure of the time (glycine clock) since the separation of compared species. This approach is applied to 370 pairwise alignments of protein sequences from over 100 species of 6 major kingdoms. The evolutionary tree is derived, where the kingdoms separate consecutively from the central stem in the order: Eubacteria (13.5% G at the moment of separation), Archaea (11.5%), Protoctista (10.5%), Fungi (9%), Planta/Animalia (8%), largely consistent with common knowledge on the evolution of the kingdoms. The glycine content, thus, may serve as a time label that allows the tracing back of the separation of any two species with potential accuracy of the order of 50 to 100 million years, all the way to the very origin of species.
机译：在共识排序中总结了二十五个不同的单因素标准以及关于氨基酸在早期进化中出现的时间顺序的假设。因此，所有有关遗传密码起源和进化的可用知识和思想都被合并到一个列表中，其中氨基酸从最早的G，A，D，V，P，S，E开始按降序排列。 L，T，I，N，F，H，K，R，Q，C，M，Y，W可以预期，在古代蛋白质的组成中，最早的氨基酸将占主导地位。实际上，当同源原核和真核蛋白质序列比对时，匹配氨基酸中最常见的残基（大概是共同祖先序列的残基）是甘氨酸，在现代蛋白质中，甘氨酸的含量约为6％至7％，而甘氨酸的含量约为6％ 。然后，匹配残基中甘氨酸的含量可以作为自比较物种分离以来的时间（甘氨酸时钟）的量度。该方法应用于来自6个主要王国的100多种物种的370个蛋白质序列的成对比对。衍生出进化树，其中各界按顺序从中央茎连续分离：真细菌（分离时G的13.5％），古细菌（11.5％），原核生物（10.5％），真菌（9％），植物/动物（8％），与王国发展的常识基本一致。因此，甘氨酸的含量可以用作一个时间标签，允许追溯任何两个物种的分离，潜在精度约为50到1亿年，一直到物种起源为止。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号