...
  • 主题
高级搜索  >
历史搜索 清空历史
首页> 外文期刊>Mitochondrial DNA Part B >The complete chloroplast genome sequence of Caryodaphnopsis tonkinensis
【24h】

The complete chloroplast genome sequence of Caryodaphnopsis tonkinensis

机译：敦煌纹夜蛾的叶绿体全基因组序列

获取原文
           
页面导航
  • 摘要
  • 著录项
  • 相似文献
  • 相关主题

摘要

The first complete chloroplast genome (cpDNA) sequence of Caryodaphnopsis tonkinensis was determined from Illumina HiSeq pair-end sequencing data in this study. The cpDNA is 149,016?bp in length, contains a large single copy region (LSC) of 91,915?bp and a small single copy region (SSC) of 17,703?bp, which were separated by a pair of inverted repeats (IR) regions of 19,699?bp. The genome contains 126 genes, including 81 protein-coding genes, eight ribosomal RNA genes, and 36 transfer RNA genes. The overall GC content of the whole genome is 39.0%, and the corresponding values of the LSC, SSC, and IR regions are 37.7%, 34.4%, and 44.4%, respectively. Further phylogenomic analysis showed that C. tonkinensis clustered in a clade in Lauraceae family.
机译：根据本研究中的Illumina HiSeq对末端测序数据，确定了唐氏拟南芥的第一个完整的叶绿体基因组（cpDNA）序列。 cpDNA的长度为149,016？bp，包含一个91,915？bp的大单拷贝区（LSC）和一个17,703？bp的小单拷贝区（SSC），它们之间被一对反向重复序列（IR）隔开19,699？bp。该基因组包含126个基因，其中包括81个蛋白质编码基因，8个核糖体RNA基因和36个转移RNA基因。整个基因组的总GC含量为39.0％，LSC，SSC和IR区域的对应值分别为37.7％，34.4％和44.4％。进一步的系统生物学分析表明，C。 tonkinensis聚集在月桂科的一个进化枝中。

著录项

相似文献

  • 外文文献
  • 中文文献
  • 专利
获取原文

客服邮箱：kefu@zhangqiaokeyan.com

京公网安备：11010802029741号 ICP备案号：京ICP备15016152号-6 六维联合信息科技 (北京) 有限公司©版权所有

  • 客服微信

  • 服务号