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Complete genome sequencing and analysis of Saprospira grandis str. Lewin, a predatory marine bacterium

机译：完整的Saprospira grandis str基因组测序和分析。 Lewin，掠食性海洋细菌

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Saprospira grandis is a coastal marine bacterium that can capture and prey upon other marine bacteria using a mechanism known as ‘ixotrophy’. Here, we present the complete genome sequence of Saprospira grandis str. Lewin isolated from La Jolla beach in San Diego, California. The complete genome sequence comprises a chromosome of 4.35 Mbp and a plasmid of 54.9 Kbp. Genome analysis revealed incomplete pathways for the biosynthesis of nine essential amino acids but presence of a large number of peptidases. The genome encodes multiple copies of sensor globin-coupled rsbR genes thought to be essential for stress response and the presence of such sensor globins in Bacteroidetes is unprecedented. A total of 429 spacer sequences within the three CRISPR repeat regions were identified in the genome and this number is the largest among all the Bacteroidetes sequenced to date.
机译：巨大的腐生螺旋藻是一种沿海海洋细菌，可以利用一种称为“ ixotrophy”的机制捕获并捕食其他海洋细菌。在这里，我们介绍了Saprospira grandis str的完整基因组序列。 Lewin从拉霍亚海滩隔离在加利福尼亚州圣地亚哥。完整的基因组序列包含4.35 Mbp的染色体和54.9 Kbp的质粒。基因组分析显示九种必需氨基酸的生物合成途径不完整，但存在大量肽酶。基因组编码传感器球蛋白偶联的rsbR基因的多个副本，这些基因被认为对应激反应至关重要，而拟杆菌中这种传感器球蛋白的存在是前所未有的。在基因组中的三个CRISPR重复区域中总共鉴定出429个间隔子序列，这个数字是迄今为止所有测序的拟杆菌中最大的。

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