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【24h】

Global Escherichia coli Sequence Type 131 Clade with bla CTX-M-27 Gene

机译：具有bla CTX-M-27基因的全球大肠杆菌131型进化枝

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The Escherichia coli sequence type (ST) 131 C2/ H 30Rx clade with the bla CTX-M-15 gene had been most responsible for the global dissemination of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)–producing E. coli . ST131 C1/ H 30R with bla CTX-M-27 emerged among ESBL-producing E. coli in Japan during the late 2000s. To investigate the possible expansion of a single clade, we performed whole-genome sequencing for 43 Japan and 10 global ST131 isolates with bla CTX-M-27 (n = 16), bla CTX-M-14 (n = 16), bla CTX-M-15 (n = 13), and others (n = 8). We also included 8 ST131 genomes available in public databases. Core genome-based analysis of 61 isolates showed that ST131 with bla CTX-M-27 from 5 countries formed a distinct cluster within the C1/ H 30R clade, named C1-M27 clade. Accessory genome analysis identified a unique prophage-like region, supporting C1-M27 as a distinct clade. Our findings indicate that the increase of ESBL-producing E. coli in Japan is due mainly to emergence of the C1-M27 clade.
机译：带有bla CTX-M-15 基因的大肠杆菌序列类型（ST）131 C2 / H 30Rx进化枝是导致产生广谱β-内酰胺酶（ESBL）的全球传播的主要原因大肠杆菌。带有bla CTX-M-27 的ST131 C1 / H 30R在2000年代后期出现在日本生产ESBL的大肠杆菌中。为了研究单个进化枝的可能扩展，我们用bla CTX-M-27 对43个日本和10个全球ST131分离株进行了全基因组测序（n = 16） ，bla CTX-M-14 （n = 16），bla CTX-M-15 （n = 13）和其他（n = 8）。我们还在公共数据库中提供了8个ST131基因组。基于核心基因组的61株分离株分析表明，来自5个国家的bla CTX-M-27 的ST131在C1 / H 30R进化枝中形成了一个独特的簇，称为C1-M27进化枝。辅助基因组分析确定了一个独特的噬菌体样区域，支持C1-M27作为独特进化枝。我们的发现表明，日本产生ESBL的大肠杆菌的增加主要归因于C1-M27进化枝的出现。

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