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Protein Peeling 2: a web server to convert protein structures into series of protein units

机译:蛋白质剥皮2:将蛋白质结构转换为一系列蛋白质单元的Web服务器

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摘要

Protein Peeling 2 (PP2) is a web server for the automatic identification of protein units (PUs) given the 3D coordinates of a protein. PUs are an intermediate level of protein structure description between protein domains and secondary structures. It is a new tool to better understand and analyze the organization of protein structures. PP2 uses only the matrices of protein contact probabilities and cuts the protein structures optimally using Matthews' coefficient correlation. An index assesses the compactness quality of each PU. Results are given both textually and graphically using JMol and PyMol softwares. The server can be accessed from http://www.ebgm.jussieu.fr/~gelly/index.html.
机译:Protein Peeling 2(PP2)是一个Web服务器,用于在给定蛋白质3D坐标的情况下自动识别蛋白质单位(PU)。 PU是蛋白质结构域和二级结构之间蛋白质结构描述的中间水平。它是一种新工具,可以更好地了解和分析蛋白质结构的组织。 PP2仅使用蛋白质接触概率矩阵,并使用马修斯系数相关性最佳地切割蛋白质结构。指数评估每个PU的紧凑性质量。使用JMol和PyMol软件以文本和图形方式给出结果。可以从http://www.ebgm.jussieu.fr/~gelly/index.html访问该服务器。

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